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Diversidad genética y estructura poblacional de guayaba (Psidium guajava L.) en Tierralta, Córdoba-Colombia utilizando marcadores microsatélites

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dc.contributor.advisorPardo Pérez, Enriquespa
dc.contributor.authorGutiérrez Hernández, María Eugeniaspa
dc.coverage.spatialMontería, Córdobaspa
dc.date.accessioned2020-06-09T16:56:04Zspa
dc.date.available2020-06-09T16:56:04Zspa
dc.date.issued2020-06-08spa
dc.description.abstractIn the present study the genetic diversity and population structure of 36 accessions of guava in the municipality of Tierralta - Córdoba was evaluated using seven microsatellite markers. Aim. This study aimed to evaluate the genetic diversity and population structure of guava (P.guajava) in the municipality of Tierralta –Cordoba using microsatellite type molecular markers. Materials and Methods. The study was carried out from 36 samples of young leaves, the DNA of each sample was extracted by the Mini-prep method with modifications. The seven microsatellite markers were amplified by means of the PCR Touchdown technique, then analyzed on 8% polyacrylamide gel in a vertical electrophoresis chamber. Population genetic parameters: Number of alleles (Na), Effective number of alleles (Ne), Observed heterozygosity (Ho), Expected heterozygosity (He), Fixation index (F), Hardy-Weinberg equilibrium (EHW) and Analysis of molecular variance (AMOVA), were calculated with the GenAlEx 6.5 program, the Polymorphic Information Content (PIC) was determined from Cervus 3.0.7 software. The analysis of the population genetic structure was carried out with the Structure 2.3.4. The Delta-K value was determined in the Structure Harvester software. Results. In the populations studied, an average of 4.0 alleles 5 per locus is found. The average value of the effective number of alleles was 1,345, it was found that the level of expected heterozygosity (He) in guava accessions was 0.175, higher value than the observed heterozygosity (Ho) with an average of 0.075. For the fixation index (F), an average of 0.479 was established. In the Hardy-Weinberg Balance, specific differences were found in the markers. The fixation coefficient of an FIS individual presented average value 0.480, the fixation coefficient of an individual within the total FIT population, presented an average of 0.671 and the value of the fixation coefficient of a subpopulation within the total FST population was 0.404. The value of the analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that the greatest molecular variance occurred among individuals with (95%).eng
dc.description.degreelevelPregradospa
dc.description.degreenameBiólogo(a)spa
dc.description.notesArtículospa
dc.description.notesArtículospa
dc.description.resumenEn el presente estudio se evaluó la diversidad genética y estructura poblacional de 36 accesiones de guayaba en el municipio de Tierralta – Córdoba utilizando siete marcadores microsatélites. Objetivo. Este estudio tuvo como objetivo evaluar la diversidad genética y estructura poblacional de guayaba (P. guajava) en el municipio de Tierralta –Córdoba utilizando marcadores moleculares tipo microsatélites. Materiales y Métodos. El estudio se realizó a partir de 36 muestra de hojas jóvenes, el ADN de cada muestra se extrajo por el método Mini-prep con modificaciones. Los siete marcadores microsatélites se amplificaron por medio de la técnica PCR Touchdown, luego se analizaron en gel de poliacrilamida al 8% en una cámara de electroforesis vertical. Los parámetros genético poblacionales: Número de alelos (Na), Número efectivo de alelos (Ne), Heterocigosidad observada (Ho), Heterocigosidad esperada (He), Índice de fijación (F), Equilibrio de Hardy-Weinberg (EHW) y el Análisis de varianza molecular (AMOVA), se calcularon con el programa GenAlEx 6.5, el Contenido de Información Polimórfica (PIC) fue determinado a partir del software Cervus 3.0.7. El análisis de la estructura genético poblacional se realizó con el programa Structure 2.3.4. La determinación del valor Delta-K se realizó en el software Structure Harvester. Resultados. En las poblaciones estudiadas se encontró un promedio de 4,0 alelos por locus. El valor promedio del número efectivo de alelos fue 1,345, se encontró que el nivel de heterocigosidad esperada (He) en las accesiones de guayaba fue de 0,175, valor mayor a la heterocigosidad observada (Ho) con un promedio de 0,075. Para el índice de fijación (F) se presentó un promedio de 0,479. En el Equilibrio de Hardy-Weinberg se encontraron diferencias significativas en los marcadores. El coeficiente de fijación de un individuo FIS presentó valor promedio 0,480, el coeficiente de fijación de un individuo dentro de la población total FIT, presentó un promedio de 0,671 y el valor del coeficiente de fijación de una subpoblación dentro de la población total FST fue de 0,404. El valor del análisis de varianza molecular (AMOVA), revelo que la mayor varianza molecular se presentó entre individuos con un (95%).spa
dc.description.tableofcontents1. Resumen……………………………………………………………………………………….3spa
dc.description.tableofcontents2. Introducción………………………………………………………………………………….6spa
dc.description.tableofcontents3. Materiales y métodos ………………………………………………………………….8spa
dc.description.tableofcontents3.1 Área de estudio……………………………………………………………………8spa
dc.description.tableofcontents3.2 Fase de campo…………………………………………………………………….9spa
dc.description.tableofcontents3.3 Fase de laboratorio……………………………………………………………..10spa
dc.description.tableofcontents3.4 Análisis de datos………………………………………………………………….12spa
dc.description.tableofcontents4. Resultados…………………………………………………………………………………….13spa
dc.description.tableofcontents5. Discusión……………………………………………………………………………………….22spa
dc.description.tableofcontents6. Conclusión…………………………………………………………………………………….25spa
dc.description.tableofcontents7. Referencias bibliográficas…………………………………………………………….26spa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.identifier.urihttps://repositorio.unicordoba.edu.co/handle/ucordoba/2856spa
dc.language.isospaspa
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias Básicasspa
dc.publisher.programBiologíaspa
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dc.rightsCopyright Universidad de Córdoba, 2020spa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/restrictedAccessspa
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0)spa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/spa
dc.subject.keywordsPopulation structureeng
dc.subject.keywordsGuavaeng
dc.subject.keywordsSSR markerseng
dc.subject.keywordsVariabilityeng
dc.subject.proposalEstructura poblacionalspa
dc.subject.proposalGuayabaspa
dc.subject.proposalMarcadores SSRspa
dc.subject.proposalVariabilidadspa
dc.titleDiversidad genética y estructura poblacional de guayaba (Psidium guajava L.) en Tierralta, Córdoba-Colombia utilizando marcadores microsatélitesspa
dc.typeDocumento de trabajospa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_1843spa
dc.type.contentTextspa
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dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersionspa
dspace.entity.typePublication
oaire.accessrightshttp://purl.org/coar/access_right/c_16ecspa
oaire.versionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85spa
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