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Diversidad genética y estructura poblacional de Psidium guajava en Valencia Córdoba-Colombia utilizando marcadores moleculares tipo STR’S

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dc.contributor.advisorPardo Pérez, Enriquespa
dc.contributor.authorPalacio Durango, Camila
dc.date.accessioned2023-07-17T21:15:17Z
dc.date.available2023-07-17T21:15:17Z
dc.date.issued2024-07-13
dc.description.abstractObjetivo. El objetivo de esta investigación fue evaluar la variabilidad y estructura genética de P. guajava L. en la población de Valencia del departamento de Córdoba, utilizando marcadores moleculares tipo microsatélites. Materiales y Métodos. Se analizaron 31 accesiones de Psidium guajava L., para la extracción de ADN se utilizó el método Mini-prep con modificaciones a partir de hojas jóvenes deshidratadas. Se evaluaron siete marcadores microsatélites; los productos de amplificación se analizaron mediante electroforesis vertical en geles de poliacrilamida al 8%. Resultados. Se encontraron un total de 26 alelos con un promedio de 3.7 alelos por locus. Las frecuencias alélicas oscilaron entre 0,063 y 0,929. La Heterocigosidad observada (Ho) y esperada (He) presentó valores promedio de 0.097 y 0.261 respectivamente indicando baja diversidad genética en las accesiones. El índice de fijación (F) presentó una media de 0,607 mostrando un exceso de homocigotos. La prueba de Hardy-Weinberg mostró que dos marcadores presentaron desequilibrios. Conclusión. Los 31 germoplasmas de Psidium guajava L. presentaron una baja diversidad genética reflejada en un alto número de homocigotos y niveles bajos de heterocigosidad. Además, las poblaciones, aunque presentan una diferenciación genética entre sí, tienden a agruparse al proceder de la misma región, lo que sugiere que las accesiones estudiadas corresponden a individuos emparentados.spa
dc.description.degreelevelPregradospa
dc.description.degreenameBiólogo(a)spa
dc.description.modalityArtículospa
dc.description.tableofcontentsResumen…………..3spa
dc.description.tableofcontentsIntroducción…………..4spa
dc.description.tableofcontentsMateriales y métodos…………..6spa
dc.description.tableofcontentsResultados…………..10spa
dc.description.tableofcontentsDiscusión…………..17spa
dc.description.tableofcontentsConclusión…………..20spa
dc.description.tableofcontentsBibliografía…………..21spa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.identifier.urihttps://repositorio.unicordoba.edu.co/handle/ucordoba/7449
dc.language.isospaspa
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias Básicasspa
dc.publisher.placeMontería, Córdoba, Colombiaspa
dc.publisher.programBiologíaspa
dc.rightsCopyright Universidad de Córdoba, 2023spa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccessspa
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)spa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/spa
dc.subject.keywordsGenetic diversityeng
dc.subject.keywordsMicrosatelliteseng
dc.subject.keywordsHomozygouseng
dc.subject.keywordsPsidium guajavaeng
dc.subject.keywordsPopulation structureeng
dc.subject.proposalDiversidad genéticaspa
dc.subject.proposalMicrosatélitesspa
dc.subject.proposalHomocigotosspa
dc.subject.proposalPsidium guajavaspa
dc.subject.proposalEstructura poblacionalspa
dc.titleDiversidad genética y estructura poblacional de Psidium guajava en Valencia Córdoba-Colombia utilizando marcadores moleculares tipo STR’Sspa
dc.typeTrabajo de grado - Pregradospa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1spa
dc.type.contentTextspa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/articlespa
dc.type.redcolhttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTspa
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/submittedVersionspa
dcterms.references1. Gutiérrez, R. M. P.; Mitchell, S.;Solis, R. V. Psidium guajava: a review of its traditional uses, phytochemistry and pharmacology. J. Ethnopharmacol. 2008, 117(1), 1–27. https://doi.org/10.1016/j.jep.2008.01.025spa
dcterms.references2. Kumar, M.; Tomar, M.; Amarowicz, R.; Saurabh, V.; Nair, M. S., Maheshwari, C.; Satankar, V. Guava (Psidium guajava L.) leaves: Nutritional composition, phytochemical profile, and health-promoting bioactivities. Foods. 2021, 10(4), 752. https://doi.org/10.3390/foods10040752spa
dcterms.references3. Gill, K. S. Guavas. Encyclopedia of Food and Health. Elsevier. 2016, 270–277. https://doi:10.1016/b978-0-12-384947-2.00363-9spa
dcterms.references4. Parra Coronado, A. Maduración y comportamiento poscosecha de la guayaba (Psidium guajava L.). Una revisión. Revista Colombiana de Ciencias Hortícolas. 2015, 8 (2): 314-327.spa
dcterms.references5. Biffin, E.; Lucas, E. J.; Craven, L. A.; Ribeiro da Costa, I.; Harrington, M. G.; Crisp, M. D. Evolution of exceptional species richness among lineages of fleshy-fruited Myrtaceae. Annals of Botany. 2010, 106(1): 79-93. https://doi.org/10.1093/aob/mcq088spa
dcterms.references6. Bhadra, A.; Singh, R. D. Phytochemical properties of guava plants (Psidium guajava): a review. Sustainability, Agri, Food and Environmental Research. 2023, 11. https://doi.org/10.7770/safer-V11N1-art2385spa
dcterms.references7. AGRONET - Red de Información y Comunicación del Sector Agropecuario Colombiano. Reporte: Participación Departamental en la Producción y en el Área Cosechada. 2021. Recuperado de https://www.agronet.gov.co/estadistica/Paginas/home.aspx?cod=2spa
dcterms.references8. PFN – Equipo Técnico Plan Frutícola Nacional de Colombia. Plan Frutícola Nacional - Desarrollo de la fruticultura en Córdoba. Montería: Secretaría de desarrollo económico y agroindustrial de Córdoba, 2006.spa
dcterms.references9. Taylor, A. What is the most genetically diverse species?. Live Science. 2021, Retrieved 17 September 2022, from https://www.livescience.com/most-genetically-diverse-species.htmlspa
dcterms.references10. Guan, B.; Gao, J.; Chen, W.; Gong, X.; Ge, G. The Effects of Climate Change on Landscape Connectivity and Genetic Clusters in a Small Subtropical and Warm-Temperate Tree. Frontiers in plant science. 2021, 12: 671336. https://doi.org/10.3389/fpls.2021.671336spa
dcterms.references11. Rojas Gutiérrez, P. A.; Ospina Bravo, C. A.; Villafañe Palaeu, C. Manual de solicitud del contrato de acceso a recursos genéticos y sus productos derivados en Colombia. Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible. Bogotá, Colombia. 2016, https://www.minambiente.gov.co/wpcontent/uploads/2021/12/Manual_de_Solicitud_del_Contrato_de_Acceso_a_Recursos_Geneticos_y_sus_Productos_Derivados_en_Colombia.pdfspa
dcterms.references12. Doyle, J.J.;Doyle, J.L. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue. Phytochem.Bull. 1987, 19: 11–15.spa
dcterms.references13. Pardo Pérez, E.; Coronado González, J. L.; Begambre Hernández, M. Comparación de dos métodos de extracción de ADN a partir de hojas secas de guayaba (Psidium guajava L.) para estudios moleculares. Revista UDCA Actualidad & Divulgación Científica. 2021, 24(1), e1504. http://doi.org/10.31910/rudca.v24.n1.2021.1504spa
dcterms.references14. Risterucci, A. M.; Duval, M. F.; Rohde, W.; Billotte, N. Isolation and characterization of microsatellite loci from Psidium guajava L. Molecular Ecology Notes. 2005, 5: 824-826. https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2005.01050.xspa
dcterms.references15. Qiu, S.; J. Chen; S. Lin; X. Lin. A comparison of silver staining protocols for detecting DNA in polyester backed polyacrylamide gel. Brazilian Journal of Microbiology. 2012, 43(2): 649-652. https://doi.org/10.1590/S1517-83822012000200029spa
dcterms.references16. Abràmoff, D.; J. Magalhães; J. Ram. Image processing with ImageJ. Biophotonics International. 2004, 11(7): 36-42.spa
dcterms.references17. Hammer, O.; Harper, DAT.; Ryan, PD. PAST: paleontological statistics software package for education and data analysis. Palaeontol Electron. PAST. 2001, 4(1):1–9.spa
dcterms.references18. Nei, M. Genetic distance between populations. The American Naturalist. 1972, 106(949): 283-92. https://doi.org/10.1086/282771spa
dcterms.references19. Peakall, R.; Smouse,PE. GenAlEx 6. 5: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update. Bioinformatics. 2012, 28(19):2537–9. https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2005.01155.x.spa
dcterms.references20. Marshall, T.; Slate, J.; Kruuk, L.; Pemberton, J. Statistical confidence for likelihood-based paternity inference in natural populations. Mol Ecol. 1998, 7 (5): 639-655. https://doi.org/10.1046/j.1365-294x.1998.00374.x.spa
dcterms.references21. Tamura, K.; Stecher, G.; Peterson, D.; Filipski, A.; Kumar, S. MEGA6: molecular evolutionary genetics analysis version 6.0. Molecular biology and evolution. 2013, 30(12): 2725-2729. https://doi.org/10.1093/molbev/mst197spa
dcterms.references22. Pritchard, JK.; Stephens,M.; Donnelly, P. Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics. 2000, 155(2): 945-959.spa
dcterms.references23. De Oliveira, C.; Tuler, A. C.; Canal, D.; Carvalho, M. S.; Ferreira, A.; da Silva Ferreira, M. F. Genetic Diversity and Population Structure of Psidium Species from Restinga: A Coastal and Disturbed Ecosystem of the Brazilian Atlantic Forest. Biochemical Genetics. 2022, 60(6): 2503-2514. https://doi.org/10.1007/s10528-022-10222-7spa
dcterms.references24. Ma, Z.; Liu, S.; Liang, Z; Xu, S.; Hu, W. Analysis of genetic diversity of 45 guava germplasm evaluated using SSR markers. International Journal of Fruit Science. 2020, 20(3): 385–93. https://doi.org/10.1080/15538362.2019.1640168spa
dcterms.references25. Gutiérrez Hernández, M. E. Diversidad genética y estructura poblacional de guayaba (Psidium guajava L.) en Tierralta, Córdoba-Colombia utilizando marcadores microsatélites. (Tesis de grado). Universidad de Cordoba, Facultad de ciencias básicas. 2020, https://repositorio.unicordoba.edu.co/handle/ucordoba/2856?show=fullspa
dcterms.references26. Chiveu, J. C.; Mueller, M.; Krutovsky, K. V.; Kehlenbeck, K.; Pawelzik, E.; Naumann, M. Genetic diversity of common guava in Kenya: An underutilized naturalized fruit species. Fruits. 2019, 74(5): 236-248. https://doi.org/10.17660/th2019/74.5.4spa
dcterms.references27. Mehmood, A.; Luo, S.; Ahmad, N.; Dong, C.; Mahmood, T.; Sajjad, Y. ; Sharp, P. Molecular variability and phylogenetic relationships of guava (Psidium guajava L.) cultivars using inter-primer binding site (iPBS) and microsatellite (SSR) markers. Genetic Resources and Crop Evolution. 2016, 63:1345-1361. https://doi.org/10.1007/s10722-015-0322-7spa
dcterms.references28. Sitther, V.; Zhang, D.; Harris, DL.; Yadav, AK.; Zee, FT.; Meinhardt, LW.; Dhekney, SA. Genetic characterization of guava (Psidium guajava L.) germplasm in the United States using microsatellite markers. Geneti Resour Crop Evol. 2014; 61(4): 829-839. DOI: https://doi.org/10.1007/s10722-014-0078-5spa
dcterms.references29. Espín Oñate, A. V. Diversidad Genética de la guayaba (Psidium guajava) en la Isla Isabela. (Bachelor's thesis). Universidad San Francisco de Quito, Colegio de Ciencias Biológicas y Ambientales. 2018, http://repositorio.usfq.edu.ec/handle/23000/7437spa
dcterms.references30. Botstein, D.; White, RL.; Skolnick, M.; Davis, RW. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. The American Journal of Human Genetics. 1980, 32(3):314-331.spa
dcterms.references31. Kumar, C.; Kumar, R.; Singh, S. K.; Goswami, A. K.; Nagaraja, A.; Paliwal, R.; Singh, R. Development of novel g-SSR markers in guava (Psidium guajava L.) cv. Allahabad Safeda and their application in genetic diversity, population structure and cross species transferability studies. PLoS One. 2020, 15(8), e0237538. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0237538spa
dcterms.references32. Coronado, J. Diversidad genética de la guayaba (Psidium guajava L.) en el municipio de Sahagún, Córdoba-Colombia determinada por marcadores microsatélites (SSR) . (Tesis de grado). Universidad de Cordoba, Facultad de ciencias básicas. 2019.spa
dcterms.references33. Begambre Hernández, M. Diversidad y estructura genética de la guayaba dulce (Psidium guajava L.) evaluada mediante marcadores microsatélites en tres municipios de Córdoba-Colombia. (Tesis de Maestría). Universidad de Cordoba, Facultad de ciencias básicas. 2020, https://repositorio.unicordoba.edu.co/handle/ucordoba/6162.spa
dspace.entity.typePublication
oaire.accessrightshttp://purl.org/coar/access_right/c_f1cfspa
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