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Caracterización molecular de guayaba (Psidium guajava) en San Bernardo del Viento Córdoba utilizando marcadores moleculares tipo microsatélites

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dc.contributor.advisorPardo Pérez, Enrriquespa
dc.contributor.authorLeón Genes, Camila María
dc.date.accessioned2023-07-11T21:33:02Z
dc.date.available2023-07-11T21:33:02Z
dc.date.issued2024-07-05
dc.description.abstractThe objective was to evaluate the variability and genetic structure of P. guajava using microsatellite markers in five subpopulations of San Bernardo del Viento in the department of Córdoba. Forty accessions of P. guajava, DNA was extracted with the chemical method CTAB 2X and the DNA concentration was quantified in a NanoDrop; seven microsatellite markers were amplified by PCR. Then analyzed in 8% polyacrylamide gels in a vertical electrophoresis chamber, the population genetic parameters were calculated, the analysis of molecular variance (AMOVA), the Polymorphic Information Content (PIC) and an analysis of the population genetic structure was performed by Bayesian inference. An average of 3.4 alleles per locus was recorded, a high level of homozygotes was found and a genetic variability of Fst= 0.584 was obtained; the population was not found in Hardy Weinberg equilibrium, this was mainly associated to inbreeding (F= 0.973), the AMOVA test reflected greater variations among individuals with 78%; according to Bayesian inference, all individuals evaluated would present similar genetic groups and the genetic distance allows us to determine that the subpopulations present a reduced gene flow. The population of P. guajava may present a genetic risk due to low heterozygosity indexes and monomorphisms, so it is suggested to implement plans for the preservation of materials in germplasm bankseng
dc.description.degreelevelPregradospa
dc.description.degreenameBiólogo(a)spa
dc.description.modalityTrabajos de Investigación y/o Extensiónspa
dc.description.resumenCon el objetivo de evaluar la variabilidad y la estructura genética de P. guajava usando marcadores microsatélites en cinco subpoblaciones de San Bernardo del Viento del departamento de Córdoba. Se colectaron 40 accesiones de P. guajava, se extrajo el ADN con el método químico CTAB 2X y la concentración de ADN fue cuantificada en un NanoDrop; se amplificaron siete marcadores microsatelites por medio de PCR. Posteriormente se analizaron en geles de poliacrilamida al 8% en una cámara de electroforesis vertical, se calcularon los parámetros genéticos poblacionales, el análisis de varianza molecular (AMOVA), el Contenido de Información Polimórfica (PIC) y se realizó un análisis de la estructura genética poblacional mediante inferencia bayesiana. Se registró un promedio de 3,4 alelos por locus, se halló un alto nivel de homocigotos y se obtuvo una variabilidad genética de Fst= 0,584; la población no se encontró en equilibrio de Hardy Weinberg asociado principalmente a la endogamia (F= 0.973), la prueba de AMOVA reflejó mayores variaciones entre individuos con un 78%; acorde a inferencia bayesiana todos los individuos evaluados presentarían grupos genéticos similares y la distancia genética nos permite determinar que las subpoblaciones presentan un reducido flujo genético. La población de P. guajava puede presentar un riesgo genético por los bajos índices de heterocigosidad y los monomorfismos, por lo que se sugiere implementar planes de preservación de materiales en bancos de germoplasma.spa
dc.description.tableofcontentsResumen....................................................................2spa
dc.description.tableofcontentsAbstract..............................................................................2spa
dc.description.tableofcontentsIntroducción...........................................................................3spa
dc.description.tableofcontentsMarco Teórico....................................................................5spa
dc.description.tableofcontentsGeneralidades de Psidium guajava.......................................................5spa
dc.description.tableofcontentsImportancia Económica........................................ 5spa
dc.description.tableofcontentsDiversidad Genética.................................................6spa
dc.description.tableofcontentsModelo de Estructura Poblacional.....................................................6spa
dc.description.tableofcontentsMarcadores Moleculares.................................................................7spa
dc.description.tableofcontentsAntecedentes......................................................................................7spa
dc.description.tableofcontentsObjetivos..............................................................................10spa
dc.description.tableofcontentsMetodología........................................................................11spa
dc.description.tableofcontentsÁrea de estudio.......................................................................11spa
dc.description.tableofcontentsFase de Campo........................................................................11spa
dc.description.tableofcontentsFase de laboratorio...........................................................................12spa
dc.description.tableofcontentsAnálisis de Datos...............................................................................13spa
dc.description.tableofcontentsResultados y Discusión..........................................................................14spa
dc.description.tableofcontentsConclusión......................................................................................................29spa
dc.description.tableofcontentsBibliografía...........................................................................................30spa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.identifier.urihttps://repositorio.unicordoba.edu.co/handle/ucordoba/7411
dc.language.isospaspa
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias Básicasspa
dc.publisher.placeMontería, Córdoba, Colombiaspa
dc.publisher.programBiologíaspa
dc.rightsCopyright Universidad de Córdoba, 2023spa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccessspa
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)spa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/spa
dc.subject.keywordsGenetic diversityeng
dc.subject.keywordsInbreedingeng
dc.subject.keywordsHeterozygouseng
dc.subject.keywordsMonomorphismseng
dc.subject.keywordsGenetic variabilityeng
dc.subject.proposalDiversidad genéticaspa
dc.subject.proposalEndogamiaspa
dc.subject.proposalHeterocigotospa
dc.subject.proposalMonomorfismosspa
dc.subject.proposalVariabilidad genéticaspa
dc.titleCaracterización molecular de guayaba (Psidium guajava) en San Bernardo del Viento Córdoba utilizando marcadores moleculares tipo microsatélitesspa
dc.typeTrabajo de grado - Pregradospa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fspa
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