G.D.A. Tesis

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    PublicaciónRestringido
    Abordaje epidemiológico, clínico y entomológico de la Leishmaniasis en el departamento de Córdoba
    (2024-08-23) Espitia Delgado, Yeiner Miguel; Yasnot Acosta, María Fernanda; Ricardo Caldera, Dina; Abad Martínez, Lili
    Este estudio tiene como objetivo determinar el perfil epidemiológico, clínico e inmunológico de la leishmaniasis cutánea en el departamento de Córdoba, así como analizar la composición de la fauna flebotomínea en los sitios de estudio. Materiales y Métodos. Se realizó un estudio transversal descriptivo de la epidemiología de la leishmaniasis en el departamento de Córdoba entre los años 2012 y 2023, utilizando datos del Sistema de Vigilancia en Salud Pública (SIVIGILA) y el Instituto Nacional de Salud (INS) de Colombia. Para el estudio clínico e inmunológico, se involucraron 23 pacientes diagnosticados con leishmaniasis cutánea y 23 controles sanos entre febrero y diciembre de 2023. Las concentraciones plasmáticas de citoquinas (IL-1β, IL-6, TNF-α, IL-10 y TGF-β1) fueron determinadas mediante citometría de flujo. Para la identificación de Lutzomyias spp, se realizó muestreo en las veredas Saiza, Nuevo Paraíso y Castilleral en los municipios de Tierralta, Puerto Escondido y San Andrés de Sotavento respectivamente, utilizando trampas CDC, y para la identificación taxonómica se utilizó la clave de Young & Duncan (1994) Resultados. Entre 2012 y 2023, se reportaron 94,275 casos de leishmaniasis en Colombia, con una alta incidencia en el departamento de Córdoba (98.01%). De los 23 pacientes estudiados, 13 de los pacientes fueron mujeres jóvenes, con una mediana de edad de 29 años. 12 (52.17%) pacientes tuvieron lesiones únicas y 11 (47,83%) pacientes múltiples. Las concentraciones de TNF-α, IL-10, IL-6 y TGF-β1 fueron significativamente más altas en pacientes con leishmaniasis cutánea en comparación con los controles sanos. El análisis entomológico identificó seis especies de flebótomos en la región, destacando Lu. dysponeta y Lu. evansi como las más prevalentes. Conclusiones. La leishmaniasis cutánea (LC) sigue siendo la forma predominante en el departamento de Córdoba, especialmente en Tierralta, Valencia y Puerto Libertador. Los hombres jóvenes presentan mayor frecuencia de LC, y los pacientes con una sola lesión tienen mejor pronóstico. El perfil de citoquinas sugiere una respuesta Th1 y Treg, con TGF-β como posible factor protector.
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    PublicaciónEmbargo
    Aspectos epidemiológicos de la pandemia por SARS-CoV-2 en el municipio de Mitú, departamento de Vaupés- 2020-2021
    (Universidad de Cordoba, 2024-07-12) Hurtado, Hollman Miller; Arrieta Bernate, German
    El presente estudio tiene como objetivo principal comprender el estado de la infección por el virus SARS-CoV-2 en la población de ascendencia indígena en Mitú, Vaupés, durante el año 2020. La investigación se enmarca en la necesidad de comprender cómo esta enfermedad ha impactado y podría continuar afectando a comunidades que mantienen vínculos estrechos con la naturaleza y que, por ende, pueden estar expuestas a diferentes riesgos de infección. La relevancia de este estudio radica en su enfoque específico en una población que ha sido históricamente marginada y cuyas dinámicas culturales y sociales pueden influir en la propagación y el impacto del virus. La Amazonía colombiana, hogar de diversas comunidades indígenas, es un espacio de enorme biodiversidad, pero también de vulnerabilidad ante enfermedades infecciosas emergentes como el COVID-1. El análisis de la prevalencia viral en Mitú, así como la identificación de zonas geográficas con alta incidencia de SARS-CoV-2, permitirá entender los patrones de propagación y establecer estrategias de control y prevención adaptadas a estas comunidades. Además, se buscará analizar los factores demográficos asociados a la severidad de la enfermedad, lo que brindará información crucial para entender cómo la edad, género u otras variables podrían influir en la gravedad de los casos.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Caracterización clínica y patobiológica de la infección experimental con Edwardsiella tarda Y Edwardsiella anguillarum en alevinos de tilapia (Oreochromis sp.)
    (Universidad de Córdoba, 2020-11-30) Hernández Carrascal, Jaime Alberto; Barato Gómez, Paola Andrea; CORPAVET
    Edwardsiellosis is a systemic granulomatous disease that affects a wide range of terrestrial and aquatic hosts, including tilapia (Oreochromis sp). Recently, Edwardsiella tarda was phylogenetically reclasiffied in three species: E. tarda, E. anguillarum and E. piscicida. The purpose of this research was to characterize clinically and pathobiologically the experimental infection with E. tarda and E. anguillarum in tilapia fingerlings. An experimental study was carried out with 19 groups, each with two replications, as follows: immersion inoculum (INM) and intragastric (IG) in doses 106 , 107 and 108 cfu/ml for each bacteria (E. anguilllarum and E. tarda) (12 groups), intraperitoneal inoculum (IP) at doses 106 and 107 cfu/ml equally for both microorganisms (4 groups), and three (3) negative control groups with inoculation of sterile physiological buffered solution (PBS) by the respective routes inoculation (IP, IG, or IMM). During the experimental period (30 days) the fish were clinically evaluated (signs and gross lesions). The fingerlings were weighed at three times: at day 0 start of the experiment, at day 15 (first phase) and at day 30, culmination of the experiment (second phase). The fish inoculated with E. anguillarum (18-355) and with E. tarda (18- 294) by IP route after day 4PI and 7PI presented ascites, whitish masses in the peritoneum and spleen, hepatomegaly, splenomegaly, absence of food in the intestine and gallbladder distention. By the IG route with E. anguillarum, 25% of mortality was presented with 106 cfu/ml, 33% with 107 cfu/ml and 58% with 108 cfu/ml; with this same bacterium by the INM route with 106 cfu/ml there was no mortality during the first 15 days, with 107 cfu/ml it was 50% and with 108 cfu/ml it was 55%. With E. tarda by inoculation via IG and INM for a period of 1 to 15 days PI there was no mortality, and during days 15 to 30 PI the fish inoculated by INM with 108 cfu/ml had 43% mortality. At day 30 PI, significant differences (P
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    PublicaciónAcceso abierto
    Caracterización eco-epidemiológica de un brote de leishmaniasis visceral en el corregimiento Sabanas de la Negra, municipio de Sampués, Sucre
    (2020-07-08) Guzmán Vásquez, Daniel Alberto
    La leishmaniasis en Colombia es considerada un problema de Salud Pública, con un promedio anual de 8.700 casos informados (2016-2018). En la Costa Caribe de Colombia se encuentra el segundo macrofoco de leishmaniasis visceral (LV) más importante del país, y dentro de esta región, el departamento de Sucre, ocupó el segundo lugar en número de casos de esta enfermedad en el periodo 2008 a 2019; aunque se tiene una visión global de los actores que participan en el mantenimiento del ciclo epidemiológico de la leishmaniasis en el macrofoco, sus determinantes epidemiológicos varían en cada microfoco, lo que motivó el interés por conocer la identidad de los parásitos, vectores y reservorios asociados a un nuevo brote de leishmaniasis visceral registrado en el 2016 en el corregimiento Sabanas de la Negra, en el municipio de Sampués, Sucre. Los flebotomíneos se capturaron con trampas de luz emitida por diodos tipo Unisucre, estos fueron identificados taxonómicamente y se les extrajo el ADN para hacer la detección de parásitos del género Leishmania mediante PCR del minicírculo, además, a los flebotomíneos con ingesta sanguínea se les determinó la frecuencia de uso de vertebrados como fuentes de sangre, mediante la amplificación diferencial del gen citocromo b (Cyt b) por PCR Múltiple. Los vertebrados silvestres (roedores, zarigüeyas, perezosos) fueron capturados con trampas Sherman, Tomahawk y búsqueda directa; los animales domésticos (caninos, equinos, bovinos) fueron capturados con ayuda de sus dueños, previo consentimiento informado. A cada animal se le tomó una muestra de sangre, para detección de anticuerpos contra Leishmania spp., mediante inmunofluorescencia indirecta (IFI) y para la detección del ADN de los parásitos, que posteriormente fueron identificados con base en la secuencia de los amplicones de la región conservada del minicírculo. La determinación de la fuente sanguinea en flebotomineos alimentados, detectó en Lu. evansi material genético de Bos taurus en un 57.14 % (4/7) y de Capro hircus en un 14.28% (1/7); paralelamente, en el 28.57% (2/7) de Lu. evansi se identificó ingesta mixta: 14.28% (1/7) Bos taurus con canis familiaris y 14.28% (1/7) de B. taurus con C. hircus; del mismo modo, en Lu. gomezi fue detectado el uso de B. taurus (1/1) como fuente de alimento. Por otro lado, a partir de los ensayos serológicos (IFI) se obtuvo una sero-positividad del 50% (n:2/4) en caninos, del 50% (2/4) en equinos y del 9.09% (1/9) en roedores. A partir de los análisis filogenéticos se determinó que Leishmania infantum es la especie infectante en los flebotomíneos y mamíferos, con una frecuencia mínima de infección de 3.2% (n:5/158) en Lutzomyia evansi, 22.7% (n:5/22) en Lu. panamensis, 21.4% (n:3/14) en Lu. cayennensis cayennensis, 66.6% (n:4/6) en Lu. gomezi, y en Lu. dubitans y en Lu. rangeliana se encontró un individuo infectado (n:1/2) de forma similar; la prevalencia de infección en roedores fue de 18,2% (n: 2/11), en zarigüeyas 22,2% (n:2/9), en caninos, equinos y bovinos fue del 50% (2/4) en cada uno y del 100% (2/2) en osos perezosos. Estos resultados son concordantes con los registros e historiales epidemiológicos que presentan los flebtomíneos y vertebrados como vectores y reservorios de Leishmania spp., en el país y con base en ésto se generó la evidencia necesaria para concluir que en el brote estudiado de LV, existió un ciclo de transmisión doméstico rural, que involucra a Lu. evansi, Lu. panamensis y Lu. gomezi como potenciales vectores, y a mamiferos domésticos, sinantrópicos y silvestres que actuarían como potenciales reservorios, por tanto, se recomienda desarrollar programas de educación, prevención y control de la enfermedad para evitar que este brote se convierta en un nuevo foco de la enfermedad.
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    PublicaciónEmbargo
    Caracterización genética de influenzavirus y coronavirus en murciélagos de los departamentos de Córdoba y Bolívar- Colombia
    (Universidad de Córdoba, 2024-07-10) Echeverri De la Hoz, Daniel Mauricio; Martinez Bravo, Caty Milena; Gastelbondo Pastrana, Bertha Irina; Mattar Velilla, Salim; Rodriguez Villamizar, Fernando; Soler-Tovar, Diego
    Los murciélagos son un grupo de mamíferos caracterizados por albergar patógenos de importancia en salud pública y animal. A pesar de ser caracterizados como un grupo taxonómica de vigilancia epidemiológica, el surgimiento del nuevo influenza virus de murciélagos y la reciente pandemia del COVID-19 causada por el SARS-CoV-2, aumentó el interés de los investigadores en comprender el papel de estos mamíferos en el mantenimiento y circulación de dichos virus. El objetivo de este estudio fue caracterizar la diversidad genética de coronavirus e influenza virus en murciélagos de los departamentos de Córdoba y Bolívar, Colombia. Se procesaron 106 animales para la detección molecular de coronavirus e influenza. Quince muestras fueron secuenciadas por RNA-Seq (NGS). Se obtuvo el genoma completo de un coronavirus y un influenza virus. Los análisis filogenéticos y reloj molecular indican que se trata de un nuevo virus del género Alphacoronavirus altamente divergente que proviene de un nodo ancestral. Mientras que, el influenza virus está asociado a los influenza A virus de murciélagos descritos anteriormente. En el análisis de la arquitectura antigénica, la proteína Spike del AlphaCov muestra similitud con TGEV y HCoV-229E con capacidad de unirse al CD13 de humanos y porcinos. La neuraminidasa del influenza A virus presenta cambios antigénicos en el sitio putativo de unión que le permite unirse al HLA-DR de murciélagos, lo que sugiere que recupera su actividad catalítica. Este es el primer estudio de caracterización filogenética, evolutiva y antigénica de coronavirus e influenza virus en murciélagos de Colombia.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Detección de DENV y ZIKV en pacientes con síndrome febril agudo en el departamento de Córdoba
    (2022-01-24) Avilés Vergara, Paula Andrea; Ricardo Caldera, Dina Marcela
    Objective To determine simultaneous circulation of DENV serotypes and ZIKV in Córdoba, Colombia, during 2015 and 2016. Material and methods A total of 294 samples from patients with clinical diagnosis of febrile syndrome compatible with dengue were collected between June 2015 and December 2016. All samples were tested for DENV and ZIKV by RT-PCR using C6/36 cells culture supernatant. Results Thirty-three percent of the samples were positive (97/294); from these, 61.8% were positive for DENV and 31% were positive for Zika. The predominant serotype was DENV-2 (70.1%), followed by DENV-3 (8.9%), DENV-4 (6%), and DENV-1 (3%). DENV/ZIKV coinfection was identified in 7.2% of the cases associated with DENV-2 and DENV-4 serotypes. The confirmed cases of dengue, Zika, and DENV/ZIKV coinfections were clinically mild and self-limited. Conclusions We reported the co-circulation of all four DENV serotypes, with a higher frequency of DENV-2. ZIKV introduction in Córdoba department-Colombia in August 2015 favored the appearance of DENV/ZIKV coinfections.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Dinámica clínica, sociodemográfica y espacial de la infección por SARS-COV-2 en el departamento de Córdoba
    (Instituto de Investigaciones Biológicas del Trópico (Unicordoba) - Minciencias, 2021-07-07) Garay, Evelin Montalvo; Serrano Coll, Héctor Alejandro; Guzmán Terán, Camilo; Andrés Felipe Diaz Delgadillo
    The serological evaluation of SARS-CoV-2 is an alternative that allows knowing the prevalence and dynamics of this infection in populations. Aim. To determine the clinical and socio-demographic dynamics of SARS-CoV-2 infection in a region of the Colombian Caribbean. Methods. Between July and November 2020, a cross-sectional observational study was carried out. The work was carried out in Córdoba, located in the northeast of Colombia in the Caribbean area. Eight municipalities with the largest population were chosen, and 2,564 blood samples were taken. The commercial ELISA was used with the recombinant protein antigen N of SARS-CoV-2. The people included in the study were asked for sociodemographic and clinical data related to pulmonary and extra-pulmonary manifestation of this disease, which were analyzed by statistical methods. Results. A seroposivity of 40.8% was obtained for SARS-CoV-2 in the Cordoba region of the Colombian Caribbean. In the bivariate analysis, no differences were observed in seropositivity against SARS-CoV-2 about gender or age range (P> 0.05). Higher seropositivity was found in low socioeconomic status and symptomatic patients (P <0.0001). 30.7% of the asymptomatic patients were seropositive for SARS-CoV-2, which would be linked to the spread of this infection. In the multivariate analysis, seroconversion was related to poverty and clinical manifestations such as anosmia and ageusia (P <0.05). Conclusions. The high seropositivity in the department of Córdoba would be related to a possible community immunity. Seropositivity would be related to clinical manifestations such as anosmia and ageusia. In addition, the association between seropositivity and socioeconomic level suggests an appropriate context for the transmission of the virus, this being determined by informal economic activities in low-income groups.
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    PublicaciónEmbargo
    Estudio molecular de especies de Borrelia y Coxiella en garrapatas Ixodidae del departamento del Atlántico
    (Universidad de Córdoba, 2024-01-30) Rosa Jaramillo, Steffania De la; López Mejia, Yesica; Badillo Viloria, María Auxiliadora; Contreras Cogollo, Verónica; Miranda, Jorge
    Las garrapatas son ectoparásitos hematófagos que infestan a la mayoría de los vertebrados. Clasificadas en tres familias: Argasidae (garrapatas blandas), Ixodidae (garrapatas duras). Algunas especies de la familia Ixodidae son vectores de diversos patógenos, siendo una preocupación para la salud humana y animal. Dentro de las principales bacterias zoonóticas transmitidas por garrapatas se encuentras especies de Borrelia sp, Coxiella sp., Rickettsia rickettsii, Anaplasma phagocitophylum, Ehrlichia chaffeensis, entre otras. En Colombia se han identificado 58 especies de garrapatas; 43 de la familia Ixodidae) entre las que se resaltan Rhipicephalus microplus, Rhipicephalus sanguineus, Amblyomma complejo cajennense, Amblyomma dissimile, Dermacentor nitens, entre otros. El conocimiento sobre las especies de Borrelia y Coxiella que circulan en garrapatas duras en el departamento del Atlántico, es crucial, para evaluar el riesgo de infecciones e identificar nuevas especies. Objetivo. Estudiar la distribución molecular de especies de Borrelia y Coxiella en garrapatas Ixodidae recolectadas de animales domésticos, silvestres y de vida libre en el departamento del Atlántico, Colombia. Materiales y métodos. Se realizó un estudio de corte transversal descriptivo a partir de 3045 garrapatas. Las muestras fueron recolectadas entre enero de 2021 a noviembre de 2022 en 18 municipios de las cinco subregiones del departamento del Atlántico, Colombia. Las garrapatas se identificaron a nivel de especie mediante claves morfológicas y se agruparon en 509 grupos. Los grupos de garrapatas se maceraron y se empleó 200μl del macerado para la extracción. La extracción de ADN se llevó a cabo utilizando el kit comercial GeneJET Genomic DNA Purification Kit (Thermo Scientific, Waltham, Massachusetts, EE. UU). Todos los grupos se analizaron para detectar la presencia de Borrelia spp. y Coxiella sp. mediante una Reacción en Cadena de la Polimerasa en tiempo real (qPCR) utilizando cebadores forward Bor16S3F y reverse Bor16S3R y una sonda Probe Bor16S3P dirigidos al gen 16S rRNA para especies de Borrelia y cebadores forward Trans-1F e reverse Trans-2R y una sonda Probe Coxiella sp. TM ([6FAM]) dirigidos a la secuencia de inserción IS1111 para Coxiella. Las muestras con punto de corte Cq <33 se sometieron a PCR anidadas y convencionales semianidadas para amplificar fragmentos de los genes 16S rRNA y flaB para Borrelia sp. Los fragmentos de secuencias se ensamblaron empleando el software MEGAX y los análisis filogenéticos se realizaron con IQ-TREE2 version 2.2.2.6. Resultados. Las garrapatas fueron identificadas morfológicamente como Amblyomma dissimile (5,02%), Amblyomma patinoi (0,39%), Amblyomma sp. (0,09%), Dermacentor nitens (35,9 %), Rhipicephalus microplus (51,2%), Rhipicephalus sanguineus sensu lato (7,4%). Se confirmó la identidad de Amblyomma patinoi en el departamento del Atlántico. Un total de 38 grupos (7,5%; IC95% 5.3-10.1; p= <0,001) analizados resultaron positivos para Borrelia sp. Los grupos analizados para la secuencia de inserción IS1111 de Coxiella sp. ninguno resultó positivo. El análisis BlastN de los fragmentos de los genes 16S rRNA y flaB mostro que las secuencias compartían similitud entre un 98,87 y 100% con Borrelia theileri y del 99.52% con Borrelia sp. depositada en GenBank. Los análisis filogenéticos por el método de máxima verosimilitud del gen 16S rRNA mostraron que la mayoría de las secuencias de Borrelia spp. se agrupaban a con secuencia de Borrelia theileri, y una secuencia de Borrelia sp. detectada en Amblyomma dissimile se agrupaba al clado de Borrelia asociado a reptiles (REP). Conclusiones: Los resultados filogenéticos muestran la distribución geográfica de B. theileri y Borrelia sp. asociada a reptiles recolectadas de animales domésticos, vida silvestre y garrapatas de vida libre en las cinco subregiones del departamento. La frecuencia de Borrelia theileri y su distribución en las cinco subregiones del departamento del Atlántico, sugiriendo que existe un riesgo potencial de borreliosis animal en estas áreas. Estos hallazgos son el primer informe sobre la presencia de Borrelia sp. en Amblyomma dissimile de garrapatas de reptiles en Colombia que se suman a la distribución geográfica de Borrelia spp. a América.
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    PublicaciónEmbargo
    Implementación y validación de un método de diagnóstico de rickettsia sp. del grupo de las fiebres manchadas mediante inmunofluorescencia indirecta (IFI) con antígenos de Candidatus Rickettsia Colombianensi.
    (Universidad de Cordoba, 2024-11-18) Garcia Perez, Alejandra ; Miranda Regino, Jorge; Mejía, Yesica; Bermúdez, Sergio; yesica lopez mejia
    A lo largo de la historia de la humanidad las enfermedades transmitidas por vectores ha sido uno de los principales problemas de salud pública. Las rickettsias son bacterias Gram negativas pleomórficas son intracelulares obligadas, no forman esporas, se encuentran libres en el citosol de la célula eucariota donde se dividen por fisión binaria. Rickettsiaceae incluye dos géneros Rickettsia y Orienta; Rickettsia agrupa a las especies patógenas para los humanos causantes de Rickettsiosis de interés en salud pública. Rickettsia a través de los años ha representado un reto importante por la dificultad del diagnóstico especialmente en las áreas donde son endémicas. La IFI tradicionalmente ha sido la técnica de diagnóstico para el seguimiento y control. La dificultad del diagnóstico de la rickettsiosis se debe a que los síntomas son similares con otros síndromes febriles agudos inespecíficos. Por esta razón, muchos casos de rickettsiosis son clasificados como fiebre aguda inespecífica y quedan sin diagnóstico confirmado. Por otro lado, existe reactividad cruzada de los anticuerpos contra los antígenos de las diferentes especies de Rickettsia. La reacción cruzada se debe a las proteínas de superficie OMPA y OMPB compartidas entre las especies de Rickettsia.nción de antígenos en laboratorios BSL-2.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Vigilancia de agentes infecciosos transmitidos por roedores (Rodentia) del municipio de Villavicencio y su impacto en la salud pública
    (Universidad de Córdoba, 2021-06-02) Rojas Gulloso, Andrés; Sánchez Lerma, Liliana; Mattar Velilla, Salim
    Las infecciones zoonóticas, siempre han figurado entre la amplia gama de enfermedades humanas y la mayoría como la brucelosis, tuberculosis, peste bubónica, fiebre amarilla e influenza, provienen de animales domésticos, artrópodos, aves de corral y ganado. Los roedores, desempeñando un papel importante en la ecología y en la transmisión de nuevas enfermedades. Objetivo: Se realizó una búsqueda de agentes infecciosos zoonóticos transmitidos por roedores (Rodentia) como parte de un programa de vigilancia en áreas periurbanas y rurales del municipio de Villavicencio durante los años 2018-2020. Metodología: Se realizó un estudio observacionaldescriptivo, de corte transversal para vigilar la presencia de algunos agentes infecciosos zoonóticos (Leptospira spp, Yersina pestis, Trypanosoma cruzi, Orthohantavirus y Mammarenavirus) transmitidos por roedores mediante el uso de técnicas moleculares que permitirán conocer su importancia en la salud pública, y su impacto en la ecología de las enfermedades en una salud. Resultados: 50 roedores fueron capturados en áreas domiciliarias, peridomiciliarias y de campo. El 12% de los roedores amplificaron los marcadores pfLp32 para identificación de Leptospira interrogans y el 10% amplificaron el marcador Yp para la detección de Yersinia pestis, siendo Rattus rattus la especie con mayor frecuencia en ambos resultados. Durante la investigación no se logró amplificar los marcadores para Trypanosoma cruzi, Orthohantavirus y Mammarenavirus. Conclusión: Se confirmó la presencia de L. interrogans y de la posible presencia de Y. pestis en tejido renal y bazo de roedodes sinantrópicos y silvestres de Villaviciencio lo que podría convertirse en un ciclo de infecciones en la región. Recomendaciones: La vigilancia de poblaciones de roedores permite conocer la interacción entre los patógenos y sus huéspedes y otras especies ante enfermedades zoonóticas emergentes que a su vez permite implementar programas de prevención y control ante emergencias humanas, buscado estrategias de mitigación para dar respuestas eficaces y oportunas.