G.D.A. Tesis

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Examinando G.D.A. Tesis por Materia "Colombia"

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    PublicaciónRestringido
    Abordaje epidemiológico, clínico y entomológico de la Leishmaniasis en el departamento de Córdoba
    (2024-08-23) Espitia Delgado, Yeiner Miguel; Yasnot Acosta, María Fernanda; Ricardo Caldera, Dina; Abad Martínez, Lili
    Este estudio tiene como objetivo determinar el perfil epidemiológico, clínico e inmunológico de la leishmaniasis cutánea en el departamento de Córdoba, así como analizar la composición de la fauna flebotomínea en los sitios de estudio. Materiales y Métodos. Se realizó un estudio transversal descriptivo de la epidemiología de la leishmaniasis en el departamento de Córdoba entre los años 2012 y 2023, utilizando datos del Sistema de Vigilancia en Salud Pública (SIVIGILA) y el Instituto Nacional de Salud (INS) de Colombia. Para el estudio clínico e inmunológico, se involucraron 23 pacientes diagnosticados con leishmaniasis cutánea y 23 controles sanos entre febrero y diciembre de 2023. Las concentraciones plasmáticas de citoquinas (IL-1β, IL-6, TNF-α, IL-10 y TGF-β1) fueron determinadas mediante citometría de flujo. Para la identificación de Lutzomyias spp, se realizó muestreo en las veredas Saiza, Nuevo Paraíso y Castilleral en los municipios de Tierralta, Puerto Escondido y San Andrés de Sotavento respectivamente, utilizando trampas CDC, y para la identificación taxonómica se utilizó la clave de Young & Duncan (1994) Resultados. Entre 2012 y 2023, se reportaron 94,275 casos de leishmaniasis en Colombia, con una alta incidencia en el departamento de Córdoba (98.01%). De los 23 pacientes estudiados, 13 de los pacientes fueron mujeres jóvenes, con una mediana de edad de 29 años. 12 (52.17%) pacientes tuvieron lesiones únicas y 11 (47,83%) pacientes múltiples. Las concentraciones de TNF-α, IL-10, IL-6 y TGF-β1 fueron significativamente más altas en pacientes con leishmaniasis cutánea en comparación con los controles sanos. El análisis entomológico identificó seis especies de flebótomos en la región, destacando Lu. dysponeta y Lu. evansi como las más prevalentes. Conclusiones. La leishmaniasis cutánea (LC) sigue siendo la forma predominante en el departamento de Córdoba, especialmente en Tierralta, Valencia y Puerto Libertador. Los hombres jóvenes presentan mayor frecuencia de LC, y los pacientes con una sola lesión tienen mejor pronóstico. El perfil de citoquinas sugiere una respuesta Th1 y Treg, con TGF-β como posible factor protector.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Detección de DENV y ZIKV en pacientes con síndrome febril agudo en el departamento de Córdoba
    (2022-01-24) Avilés Vergara, Paula Andrea; Ricardo Caldera, Dina Marcela
    Objective To determine simultaneous circulation of DENV serotypes and ZIKV in Córdoba, Colombia, during 2015 and 2016. Material and methods A total of 294 samples from patients with clinical diagnosis of febrile syndrome compatible with dengue were collected between June 2015 and December 2016. All samples were tested for DENV and ZIKV by RT-PCR using C6/36 cells culture supernatant. Results Thirty-three percent of the samples were positive (97/294); from these, 61.8% were positive for DENV and 31% were positive for Zika. The predominant serotype was DENV-2 (70.1%), followed by DENV-3 (8.9%), DENV-4 (6%), and DENV-1 (3%). DENV/ZIKV coinfection was identified in 7.2% of the cases associated with DENV-2 and DENV-4 serotypes. The confirmed cases of dengue, Zika, and DENV/ZIKV coinfections were clinically mild and self-limited. Conclusions We reported the co-circulation of all four DENV serotypes, with a higher frequency of DENV-2. ZIKV introduction in Córdoba department-Colombia in August 2015 favored the appearance of DENV/ZIKV coinfections.
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    PublicaciónEmbargo
    Estudio molecular de especies de Borrelia y Coxiella en garrapatas Ixodidae del departamento del Atlántico
    (Universidad de Córdoba, 2024-01-30) Rosa Jaramillo, Steffania De la; López Mejia, Yesica; Badillo Viloria, María Auxiliadora; Contreras Cogollo, Verónica; Miranda, Jorge
    Las garrapatas son ectoparásitos hematófagos que infestan a la mayoría de los vertebrados. Clasificadas en tres familias: Argasidae (garrapatas blandas), Ixodidae (garrapatas duras). Algunas especies de la familia Ixodidae son vectores de diversos patógenos, siendo una preocupación para la salud humana y animal. Dentro de las principales bacterias zoonóticas transmitidas por garrapatas se encuentras especies de Borrelia sp, Coxiella sp., Rickettsia rickettsii, Anaplasma phagocitophylum, Ehrlichia chaffeensis, entre otras. En Colombia se han identificado 58 especies de garrapatas; 43 de la familia Ixodidae) entre las que se resaltan Rhipicephalus microplus, Rhipicephalus sanguineus, Amblyomma complejo cajennense, Amblyomma dissimile, Dermacentor nitens, entre otros. El conocimiento sobre las especies de Borrelia y Coxiella que circulan en garrapatas duras en el departamento del Atlántico, es crucial, para evaluar el riesgo de infecciones e identificar nuevas especies. Objetivo. Estudiar la distribución molecular de especies de Borrelia y Coxiella en garrapatas Ixodidae recolectadas de animales domésticos, silvestres y de vida libre en el departamento del Atlántico, Colombia. Materiales y métodos. Se realizó un estudio de corte transversal descriptivo a partir de 3045 garrapatas. Las muestras fueron recolectadas entre enero de 2021 a noviembre de 2022 en 18 municipios de las cinco subregiones del departamento del Atlántico, Colombia. Las garrapatas se identificaron a nivel de especie mediante claves morfológicas y se agruparon en 509 grupos. Los grupos de garrapatas se maceraron y se empleó 200μl del macerado para la extracción. La extracción de ADN se llevó a cabo utilizando el kit comercial GeneJET Genomic DNA Purification Kit (Thermo Scientific, Waltham, Massachusetts, EE. UU). Todos los grupos se analizaron para detectar la presencia de Borrelia spp. y Coxiella sp. mediante una Reacción en Cadena de la Polimerasa en tiempo real (qPCR) utilizando cebadores forward Bor16S3F y reverse Bor16S3R y una sonda Probe Bor16S3P dirigidos al gen 16S rRNA para especies de Borrelia y cebadores forward Trans-1F e reverse Trans-2R y una sonda Probe Coxiella sp. TM ([6FAM]) dirigidos a la secuencia de inserción IS1111 para Coxiella. Las muestras con punto de corte Cq <33 se sometieron a PCR anidadas y convencionales semianidadas para amplificar fragmentos de los genes 16S rRNA y flaB para Borrelia sp. Los fragmentos de secuencias se ensamblaron empleando el software MEGAX y los análisis filogenéticos se realizaron con IQ-TREE2 version 2.2.2.6. Resultados. Las garrapatas fueron identificadas morfológicamente como Amblyomma dissimile (5,02%), Amblyomma patinoi (0,39%), Amblyomma sp. (0,09%), Dermacentor nitens (35,9 %), Rhipicephalus microplus (51,2%), Rhipicephalus sanguineus sensu lato (7,4%). Se confirmó la identidad de Amblyomma patinoi en el departamento del Atlántico. Un total de 38 grupos (7,5%; IC95% 5.3-10.1; p= <0,001) analizados resultaron positivos para Borrelia sp. Los grupos analizados para la secuencia de inserción IS1111 de Coxiella sp. ninguno resultó positivo. El análisis BlastN de los fragmentos de los genes 16S rRNA y flaB mostro que las secuencias compartían similitud entre un 98,87 y 100% con Borrelia theileri y del 99.52% con Borrelia sp. depositada en GenBank. Los análisis filogenéticos por el método de máxima verosimilitud del gen 16S rRNA mostraron que la mayoría de las secuencias de Borrelia spp. se agrupaban a con secuencia de Borrelia theileri, y una secuencia de Borrelia sp. detectada en Amblyomma dissimile se agrupaba al clado de Borrelia asociado a reptiles (REP). Conclusiones: Los resultados filogenéticos muestran la distribución geográfica de B. theileri y Borrelia sp. asociada a reptiles recolectadas de animales domésticos, vida silvestre y garrapatas de vida libre en las cinco subregiones del departamento. La frecuencia de Borrelia theileri y su distribución en las cinco subregiones del departamento del Atlántico, sugiriendo que existe un riesgo potencial de borreliosis animal en estas áreas. Estos hallazgos son el primer informe sobre la presencia de Borrelia sp. en Amblyomma dissimile de garrapatas de reptiles en Colombia que se suman a la distribución geográfica de Borrelia spp. a América.