Examinando por Autor "Pardo Pérez, Enrique"

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    Determinación de la diversidad genética y estructura poblacional del maíz criollo (Zea mays L.) de Sahagún, Córdoba mediante marcadores microsatélites
    (2021-07-22) Martínez Chartuny, Yan Carlos; Pardo Pérez, Enrique
    El objetivo del trabajo fue analizar la diversidad genética y la estructura poblacional del maíz criollo en el municipio de Sahagún, Córdoba, utilizando marcadores microsatélites. Se tomaron muestras de 50 accesiones de Z. mays. La extracción de ADN fue realizada empleando el método de extracción CTAB 2X y precipitación por acetato de sodio, se amplificaron 12 marcadores microsatélites y sus productos fueron separados en geles de poliacrilamida al 8%. Los 12 marcadores microsatélites evaluados presentaron un alto grado de polimorfismo, mostrando así un total de 65 alelos y con un promedio de 5,41 alelos en la población, el número efectivo de alelos promedio fue 2,23, los valores del PIC oscilaron entre 0,622 y 0,703 para las subpoblaciones de Arenas del Norte y Dividivi consecutivamente. El análisis para el equilibrio Hardy Weinberg manifestó que las poblaciones estaban en desequilibrio (p<0.05). El promedio de la heterocigosidad esperada fue de 0.47, conforme al parámetro de estructura poblacional FST los valores más altos correspondieron a los loci Phi031=0,559 y Phi115=0,269, mientras que el valor más bajo lo obtuvo el marcador Phi056=0,072, en general, las poblaciones tuvieron una media de FIS=0,560 y FIT=0,633. El dendrograma realizado a partir de las distancias de Nei presentó diferencias menores al 20% entre las poblaciones. La población de maíz criollo presentó una alta diversidad genética.
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    Diversidad genética en la población humana del municipio de Momil utilizando marcadores Alu
    (Universidad De Córdoba, 2024-08-09) Gómez Peñalosa, Mary Luz; Pardo Pérez, Enrique; Cavadía Martínez, Teodora Inés; Begambre Hernández, Mauricio; Álvarez Negrete, Ana Carolina
    Con el objetivo de caracterizar la población humana del municipio de Momil mediante la utilización de marcadores Alu, se tomaron muestras de saliva de 38 personas adultas no emparentadas de cuatro regiones del municipio tanto urbana como rural: barrio las Lamas (PM), barrio Bruselas (PS), barrio Santa Lucia (PR) y vereda Pueblecito (PP). Se realizó la extracción de ADN, se amplificaron 7 marcadores Alu (ACE, D1, APO, TRA25, HS3.23, HS2.43, PV92) mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y los amplicones fueron observados mediante electroforesis en geles de agarosa. Los análisis estadísticos mostraron que el marcador HS2.43 resulto ser monomórfico para todas las poblaciones, se presentó monomorfismos en el marcador HS3.23 para la población PS y en el marcador D1 para la población PP, las demás inserciones fueron polimórficas, la heterocigocidad observada promedio fue de 0,310 visiblemente mayor a la heterocigocidad esperada con un valor de 0,278, el marcador HS3.23 presento ausencia de equilibrio Hardy-Weinberg en la población PM, además se encontró una alta diferenciación genética entre las subpoblaciones, en conjunto, las variables de diversidad indican que la población de Momil es una región con alta diversidad genética y conforme a las distancias genéticas con poblaciones aledañas se muestra una alta similitud genética con los municipio de Lorica y Sincelejo.
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    Diversidad genética en poblaciones humanas de Sincelejo, Sucre-Colombia, determinada mediante polimorfismos de inserciones Alu.
    (2021-07-21) Conde vega, Eder Enrique; Pardo Pérez, Enrique
    The objective of this research was to determine the genetic diversity of the human population of Sincelejo, Sucre-Colombia through polymorphism of Alu insertions. Materials and Methods. The samples were obtained from 49 unrelated people in five localities of this population (Bogotá, Caribe, 20 de enero, Villa country, Cortijo), to which the DNA extraction protocol described in the Promega Wizard® Genomic DNA Purification Kit Technical Manual is applied, and were amplified by a series of polymerase chain reactions (PCR) using a series of Alu markers (ACE, A25, APO, D1, PV92, TRA25). Results. All the Alu markers evaluated in this research were polymorphic, the allelic frequencies presented an average of 0.305 with a maximum value of 0.551 for the TRA25 locus and a minimum value of 0.064 for the APO locus, a moderate heterozygosity observed in the population was detected, where the values presented a fluctuation of a minimum value of 0.125 for the APO locus and a maximum value of 0.471 for the PV92 locus. Marker D1 presents an absence of Hardy-Weinberg equilibrium for two subpopulations of Sincelejo (Villa Country and Caribe). Conclusion. The results obtained in this research allow us to conclude that the population of Sincelejo, Sucre-Colombia has low genetic diversity due to the fact that inbreeding processes have occurred throughout the history of this population.
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    Diversidad genética en poblaciones humanas mediante polimorfismos de inserción Alu en el municipio de Moñitos- Córdoba
    (2020-11-13) Álvarez Villegas, Lizky Paola; Pardo Pérez, Enrique
    Alu insertion elements are DNA sequences that are produced by a single mutational event and their ancestral status is known, it is estimated that there are more than a million copies of these elements, that is, they occupy approximately 11% of the human genome. The objective of the present investigation was to determine the genetic diversity of the human population of the municipality of Moñitos-Córdoba, through the use of Alu insertion polymorphisms in 50 unrelated individuals from five selected populations in the municipality. The study was carried out from saliva samples, from which the DNA was extracted, later the DNA amplification was carried out by PCR and the amplified ones were observed in agarose gels, finally through statistical analysis the following were determined: allelic frequencies, Observed heterozygosities (Ho), Expected heterozygosities (He), Fixation index, Hardy-Weinberg equilibrium and Dendograms. All Alu markers were polymorphic, with frequencies ranging between 0.100 (A25) and 0.944 (HS3.23), the average values obtained for Ho and He were respectively 0.398 and 0.384, most of the markers were found in equilibrium of Hardy-Weinberg, except for the ACE and TRA25 markers, the genetic distance between the different populations studied, showed Miramar and Flores de Manga as the most related and Santa Lucia as the most distant among the populations evaluated. In conclusion, Moñitos population presented a high polymorphic level and low values of observed and expected heterozygosity, which indicates a low rate of genetic diversity.
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    Diversidad genética y estructura poblacional de guayaba (Psidium guajava L.) en Tierralta, Córdoba-Colombia utilizando marcadores microsatélites
    (2020-06-08) Gutiérrez Hernández, María Eugenia; Pardo Pérez, Enrique
    In the present study the genetic diversity and population structure of 36 accessions of guava in the municipality of Tierralta - Córdoba was evaluated using seven microsatellite markers. Aim. This study aimed to evaluate the genetic diversity and population structure of guava (P.guajava) in the municipality of Tierralta –Cordoba using microsatellite type molecular markers. Materials and Methods. The study was carried out from 36 samples of young leaves, the DNA of each sample was extracted by the Mini-prep method with modifications. The seven microsatellite markers were amplified by means of the PCR Touchdown technique, then analyzed on 8% polyacrylamide gel in a vertical electrophoresis chamber. Population genetic parameters: Number of alleles (Na), Effective number of alleles (Ne), Observed heterozygosity (Ho), Expected heterozygosity (He), Fixation index (F), Hardy-Weinberg equilibrium (EHW) and Analysis of molecular variance (AMOVA), were calculated with the GenAlEx 6.5 program, the Polymorphic Information Content (PIC) was determined from Cervus 3.0.7 software. The analysis of the population genetic structure was carried out with the Structure 2.3.4. The Delta-K value was determined in the Structure Harvester software. Results. In the populations studied, an average of 4.0 alleles 5 per locus is found. The average value of the effective number of alleles was 1,345, it was found that the level of expected heterozygosity (He) in guava accessions was 0.175, higher value than the observed heterozygosity (Ho) with an average of 0.075. For the fixation index (F), an average of 0.479 was established. In the Hardy-Weinberg Balance, specific differences were found in the markers. The fixation coefficient of an FIS individual presented average value 0.480, the fixation coefficient of an individual within the total FIT population, presented an average of 0.671 and the value of the fixation coefficient of a subpopulation within the total FST population was 0.404. The value of the analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that the greatest molecular variance occurred among individuals with (95%).
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    Diversidad genética y estructura poblacional de Psidium guajava en Valencia Córdoba-Colombia utilizando marcadores moleculares tipo STR’S
    (2024-07-13) Palacio Durango, Camila; Pardo Pérez, Enrique
    Objetivo. El objetivo de esta investigación fue evaluar la variabilidad y estructura genética de P. guajava L. en la población de Valencia del departamento de Córdoba, utilizando marcadores moleculares tipo microsatélites. Materiales y Métodos. Se analizaron 31 accesiones de Psidium guajava L., para la extracción de ADN se utilizó el método Mini-prep con modificaciones a partir de hojas jóvenes deshidratadas. Se evaluaron siete marcadores microsatélites; los productos de amplificación se analizaron mediante electroforesis vertical en geles de poliacrilamida al 8%. Resultados. Se encontraron un total de 26 alelos con un promedio de 3.7 alelos por locus. Las frecuencias alélicas oscilaron entre 0,063 y 0,929. La Heterocigosidad observada (Ho) y esperada (He) presentó valores promedio de 0.097 y 0.261 respectivamente indicando baja diversidad genética en las accesiones. El índice de fijación (F) presentó una media de 0,607 mostrando un exceso de homocigotos. La prueba de Hardy-Weinberg mostró que dos marcadores presentaron desequilibrios. Conclusión. Los 31 germoplasmas de Psidium guajava L. presentaron una baja diversidad genética reflejada en un alto número de homocigotos y niveles bajos de heterocigosidad. Además, las poblaciones, aunque presentan una diferenciación genética entre sí, tienden a agruparse al proceder de la misma región, lo que sugiere que las accesiones estudiadas corresponden a individuos emparentados.
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    Diversidad y estructura genética de la guayaba dulce (Psidium guajava l.) evaluada mediante marcadores microsatélites en tres municipios de Córdoba-Colombia
    (Universidad de Córdoba, 2022-07-25) Begambre Hernández, Mauricio; Pardo Pérez, Enrique
    La guayaba dulce (Psidium guajava L.) es un frutal de la familia Myrthaceae de amplia distribución en zonas tropicales y subtropicales, es de gran interés comercial por sus frutos de agradable sabor y alto valor nutricional. Por su importancia económica y su condición autóctono en el departamento de Córdoba Colombia, se caracterizaron mediante marcadores moleculares tipo microsatélites (SSR) tres poblaciones de P. guajava correspondientes a los municipios de Sahagún, Tierralta y Cereté. De los doce marcadores evaluados siete resultaron polimórficos y presentaron un total de 44 alelos distribuidos en tres poblaciones. El Contenido de Información Polimórfica (PIC) fue variable en los territorios encontrándose los marcadores mPgCIR07 y mPgCIR20 como altamente informativos. La heterocigosidad observada fue de 0,179, 0,081 y 0,555 para Sahagún, Tierralta y Cereté respectivamente. El coeficiente de diferenciación entre las poblaciones presenta una media de FST = 0,271 y un porcentaje de variación interpoblacional de 7 %, estos resultados se reflejaron en el agrupamiento bayesiano con DeltaK = 3 como el número de grupos genéticos más probable y en la distribución diferencial de las tres poblaciones en el análisis de coordenadas principales (PCoA). Cereté se caracterizó por una elevada diversidad genética fruto de la alta actividad agrícola familiar y productividad de esta especie en los suelos del presente municipio, mientras que las poblaciones de guayaba de los municipios de Tierralta y Sahagún presentaron una alta endogamia y se halló una elevada diferenciación genética interpoblacional atribuido probablemente al escaso interés en su producción.