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Diversidad y estructura genética de la guayaba dulce (Psidium guajava l.) evaluada mediante marcadores microsatélites en tres municipios de Córdoba-Colombia

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dc.contributor.advisorPardo Pérez, Enriquespa
dc.contributor.authorBegambre Hernández, Mauricio
dc.date.accessioned2022-07-25T21:18:53Z
dc.date.available2023-07-25
dc.date.available2022-07-25T21:18:53Z
dc.date.issued2022-07-25
dc.description.abstractLa guayaba dulce (Psidium guajava L.) es un frutal de la familia Myrthaceae de amplia distribución en zonas tropicales y subtropicales, es de gran interés comercial por sus frutos de agradable sabor y alto valor nutricional. Por su importancia económica y su condición autóctono en el departamento de Córdoba Colombia, se caracterizaron mediante marcadores moleculares tipo microsatélites (SSR) tres poblaciones de P. guajava correspondientes a los municipios de Sahagún, Tierralta y Cereté. De los doce marcadores evaluados siete resultaron polimórficos y presentaron un total de 44 alelos distribuidos en tres poblaciones. El Contenido de Información Polimórfica (PIC) fue variable en los territorios encontrándose los marcadores mPgCIR07 y mPgCIR20 como altamente informativos. La heterocigosidad observada fue de 0,179, 0,081 y 0,555 para Sahagún, Tierralta y Cereté respectivamente. El coeficiente de diferenciación entre las poblaciones presenta una media de FST = 0,271 y un porcentaje de variación interpoblacional de 7 %, estos resultados se reflejaron en el agrupamiento bayesiano con DeltaK = 3 como el número de grupos genéticos más probable y en la distribución diferencial de las tres poblaciones en el análisis de coordenadas principales (PCoA). Cereté se caracterizó por una elevada diversidad genética fruto de la alta actividad agrícola familiar y productividad de esta especie en los suelos del presente municipio, mientras que las poblaciones de guayaba de los municipios de Tierralta y Sahagún presentaron una alta endogamia y se halló una elevada diferenciación genética interpoblacional atribuido probablemente al escaso interés en su producción.spa
dc.description.abstractSweet guava (Psidium guajava L.) is a fruit tree of the Myrthaceae family with a wide distribution in tropical and subtropical areas, it is of great commercial interest due to its fruits with a pleasant flavor and high nutritional value. Due to its economic importance and its autochthonous condition in the department of Córdoba-Colombia, three populations of P. guajava corresponding to the municipalities of Sahagún, Tierralta and Cereté were characterized by microsatellite-type molecular markers (SSR). Of the twelve markers evaluated, seven were polymorphic and presented a total of 44 alleles distributed in three populations. The Polymorphic Information Content (PIC) was variable in the territories, finding the markers mPgCIR07 and mPgCIR20 as highly informative. The heterozygosity observed was 0.179, 0.081 and 0.555 for Sahagún, Tierralta and Cereté, respectively. The coefficient of differentiation between populations has an average of FST = 0.271 and a percentage of interpopulation variation of 7%, these results were reflected in the Bayesian clustering with DeltaK = 3 as the most probable number of genetic groups and in the differential distribution of the three populations in the principal coordinate analysis (PCoA). Cereté was characterized by a high genetic diversity as a result of the high family agricultural activity and productivity of this species in the soils of the present municipality, while the guava populations of the municipalities of Tierralta and Sahagún presented high inbreeding and a high interpopulation genetic differentiation was found, probably attributed to little interest in its production.eng
dc.description.degreelevelMaestríaspa
dc.description.degreenameMagíster en Biotecnologíaspa
dc.description.modalityTrabajos de Investigación y/o Extensiónspa
dc.description.tableofcontentsRESUMEN............................................................................................................ 13spa
dc.description.tableofcontentsABSTRACT .......................................................................................................... 14spa
dc.description.tableofcontents1. INTRODUCCIÓN ........................................................................................... 15spa
dc.description.tableofcontents2. MARCO REFERENCIAL ................................................................................ 18spa
dc.description.tableofcontents2.1. ANTECEDENTES ...................................................................................... 18spa
dc.description.tableofcontents2.2. MARCO TEÓRICO ..................................................................................... 21spa
dc.description.tableofcontents2.2.1. LA GUAYABA DULCE Psidium guajava L. ........................................... 21spa
dc.description.tableofcontents2.2.1.1. Taxonomía ..................................................................................... 21spa
dc.description.tableofcontents2.2.1.2. Origen y distribución....................................................................... 22spa
dc.description.tableofcontents2.2.1.3. Descripción botánica ...................................................................... 22spa
dc.description.tableofcontents2.2.1.4. Importancia económica y social ..................................................... 23spa
dc.description.tableofcontents2.2.1.5. Diversidad genética de la guayaba dulce ....................................... 24spa
dc.description.tableofcontents2.2.2. DIVERSIDAD GENÉTICA .................................................................... 25spa
dc.description.tableofcontents2.2.2.1. Parámetros de Medición de la Diversidad Genética ....................... 26spa
dc.description.tableofcontents2.2.2.2. Factores que influencian la diversidad genética: ............................ 27spa
dc.description.tableofcontents2.2.3. ESTRUCTURA POBLACIONAL ........................................................... 29spa
dc.description.tableofcontents2.2.3.1. Parámetros de estructura poblacional de Wright ............................ 29spa
dc.description.tableofcontents2.2.3.2. Flujo genético ................................................................................. 30spa
dc.description.tableofcontents2.2.3.3. Análisis de varianza molecular (AMOVA) ....................................... 30spa
dc.description.tableofcontents2.2.3.4. Inferencia bayesiana de la estructura genética poblacional ............ 30spa
dc.description.tableofcontents2.2.4. DISTANCIAS GENÉTICAS .................................................................. 31spa
dc.description.tableofcontents2.2.4.1. Distancia genética de Nei ............................................................... 31spa
dc.description.tableofcontents2.2.4.2. Dendrogramas ............................................................................... 31spa
dc.description.tableofcontents2.2.5. MARCADORES MOLECULARES TIPO MICROSATÉLITES ............... 31spa
dc.description.tableofcontents3. OBJETIVOS ..................................................................................................... 33spa
dc.description.tableofcontents3.1. OBJETIVO GENERAL ................................................................................ 33spa
dc.description.tableofcontents3.2. OBJETIVOS ESPECÍFICOS....................................................................... 33spa
dc.description.tableofcontents4. MATERIALES Y MÉTODOS ............................................................................. 34spa
dc.description.tableofcontents4.1. ÁREA DE ESTUDIO Y TOMA DE MUESTRAS .......................................... 34spa
dc.description.tableofcontents4.2. FASE DE LABORATORIO ......................................................................... 35spa
dc.description.tableofcontents4.2.2. AMPLIFICACIÓN DE MICROSATÉLITES POR PCR ........................... 36spa
dc.description.tableofcontents4.2.3. DETECCIÓN DE POLIMORFISMOS ................................................... 37spa
dc.description.tableofcontents4.3. ANÁLISIS DE DATOS ................................................................................ 38spa
dc.description.tableofcontents4.3.1. ANÁLISIS DE DIVERSIDAD GENÉTICA.............................................. 38spa
dc.description.tableofcontents4.3.2. ANÁLISIS DE ESTRUCTURA POBLACIONAL Y DISTANCIAS GENÉTICAS .................................................................................................. 38spa
dc.description.tableofcontents5. RESULTADOS ................................................................................................. 39spa
dc.description.tableofcontents5.1. AMPLIFICACIÓN DE LOS MARCADORES MICROSATÉLITES ................ 39spa
dc.description.tableofcontents5.2. DIVERSIDAD GENÉTICA .......................................................................... 39spa
dc.description.tableofcontents5.2.1. NÚMERO DE ALELOS (NA) Y PATRONES ALÉLICOS ....................... 39spa
dc.description.tableofcontents5.2.2. CONTENIDO DE INFORMACIÓN POLIMÓRFICA (PIC) ..................... 41spa
dc.description.tableofcontents5.2.3. HETEROCIGOSIDAD OBSERVADA (HO) Y HETEROCIGOSIDAD ESPERADA (HE) ............................................................................................ 42spa
dc.description.tableofcontents5.2.4. ÍNDICE DE FIJACIÓN (F)..................................................................... 42spa
dc.description.tableofcontents5.2.5. EQUILIBRIO DE HARDY-WEINBERG (EHW) ....................................... 42spa
dc.description.tableofcontents5.3. ESTRUCTURA POBLACIONAL ................................................................. 44spa
dc.description.tableofcontents5.3.1. ESTADÍSTICOS F DE WRIGHT ........................................................... 44spa
dc.description.tableofcontents5.3.2. FLUJO GENÉTICO .............................................................................. 44spa
dc.description.tableofcontents5.3.3. ANÁLISIS JERÁRQUICO DE VARIANZA MOLECULAR (AMOVA) ..... 45spa
dc.description.tableofcontents5.3.4. ANÁLISIS BAYESIANO DE LA ESTRUCTURA POBLACIONAL ......... 46spa
dc.description.tableofcontents5.4. DISTANCIAS GENÉTICAS......................................................................... 47spa
dc.description.tableofcontents5.4.1. DISTANCIA GENÉTICA DE NEI (1987) ............................................... 47spa
dc.description.tableofcontents5.4.2. ANÁLISIS DE COORDENADAS PRINCIPALES (PCoA) ...................... 48spa
dc.description.tableofcontents6. DISCUSIÓN ...................................................................................................... 49spa
dc.description.tableofcontents7. CONCLUSIÓN .................................................................................................. 53spa
dc.description.tableofcontents8. RECOMENDACIONES ..................................................................................... 54spa
dc.description.tableofcontents9. REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS .................................................................. 55spa
dc.description.tableofcontents10. ANEXOS ......................................................................................................... 62spa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.identifier.urihttps://repositorio.unicordoba.edu.co/handle/ucordoba/6162
dc.language.isospaspa
dc.publisherUniversidad de Córdoba
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias Básicasspa
dc.publisher.placeMontería, Córdoba, Colombiaspa
dc.publisher.programMaestría en Biotecnologíaspa
dc.rightsCopyright Universidad de Córdoba, 2022spa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/embargoedAccessspa
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)spa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/spa
dc.subject.keywordsPsidium guajavaspa
dc.subject.keywordsGenetic diversityspa
dc.subject.keywordsMicrosatellite markerseng
dc.subject.keywordsCórdoba - Colombiaeng
dc.subject.proposalPsidium guajavaspa
dc.subject.proposalDiversidad genéticaspa
dc.subject.proposalMarcadores microsatélitesspa
dc.subject.proposalCórdoba – Colombiaspa
dc.titleDiversidad y estructura genética de la guayaba dulce (Psidium guajava l.) evaluada mediante marcadores microsatélites en tres municipios de Córdoba-Colombiaspa
dc.typeTrabajo de grado - Maestríaspa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccspa
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dc.type.redcolhttps://purl.org/redcol/resource_type/TMspa
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