Publicación:
Determinación de la infección por patógenos atípicos en pacientes con neumonía adquirida en comunidad y síndrome febril agudo inespecífico que ingresaron al Hospital San Jerónimo de Montería, Córdoba 2021-2023

Vista sencilla de ítem
dc.contributor.advisorContreras Cogollo, Verónica Marcela
dc.contributor.advisorGastelbondo Pastrana, Bertha Irina
dc.contributor.authorAvilés Pérez, Mari Cruz
dc.contributor.authorEspitia Pastrana, Luisa Alejandra
dc.contributor.juryRodríguez Rodríguez, Virginia Consuelo
dc.contributor.juryCastro Cavadia, Carlos Javier
dc.date.accessioned2024-02-02T17:39:04Z
dc.date.available2024-02-02T17:39:04Z
dc.date.issued2024-02-02
dc.description.abstractObjetivo. Determinar la infección por patógenos atípicos bacterianos en pacientes con neumonía adquirida en comunidad y síndrome febril agudo inespecífico que ingresaron al Hospital San Jerónimo de Montería, Córdoba 2021-2023. Materiales y métodos. Se realizó un estudio descriptivo, prospectivo, de corte transversal, en pacientes del Hospital San Jerónimo de Montería con síndrome febril agudo inespecífico y neumonía atípica adquirida en comunidad. Se recopiló la información de los participantes y se caracterizaron variables clinico-epidemiologicas. Se incluyeron 37 pacientes y se recolectaron muestras de sangre, suero, líquido pleural y secreción bronquial. Se realizó detección molecular de Coxiella burnetii mediante PCR en tiempo real. Se realizó PCR convencional para Mycoplasma pneumoniae, especies de Chlamydia spp, Legionella pneumophila y una PCR de amplio rango de especies de bacterias (gen 16S ARNr). Adicionalmente, las muestras de suero se analizaron mediante IFI para detectar anticuerpos IgG contra C. burnetii. Resultados. Se detectó amplificación del gen 16S ARNr en 7 casos. Se detectó amplificación del gen de Chlamydia spp en 2 pacientes. No se detectó amplificación de genes de Coxiella, Mycoplasma y Legionella. La zona rural y la edad mayor a 40 años fueron los factores más frecuentes. Conclusión. Este estudio permitió conocer un panorama importante de las enfermedades descritas, cuya etiología no es identificada mediante diagnóstico convencional. Se detectó infección bacteriana en pacientes con NAC y cultivos negativos. La secuenciación de ADN es clave para la identificación de patógenos. Se requiere profundizar el conocimiento de neumonías probablemente causadas por especies de Chlamydia spp.spa
dc.description.abstractObjective. To determine infection by atypical bacterial pathogens in patients with community-acquired pneumonia and non-specific acute febrile syndrome admitted to the Hospital San Jerónimo de Montería, Córdoba 2021-2023. Materials and methods. A descriptive, prospective, cross-sectional study was conducted in patients of the Hospital San Jerónimo de Montería with non-specific acute febrile syndrome and atypical community-acquired pneumonia. Information was collected from the participants and clinical-epidemiological variables were characterized. Thirty-seven patients were included and blood, serum, pleural fluid and bronchial secretion samples were collected. Molecular detection of Coxiella burnetii was performed by real-time PCR. Conventional PCR was performed for Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia spp, Legionella pneumophila species and a broad range of bacterial species PCR (16S rRNA gene). Additionally, serum samples were tested by IFA for IgG antibodies against C. burnetii. Results. Amplification of the 16S rRNA gene was detected in 7 cases. Chlamydia spp gene amplification was detected in 2 patients. Coxiella, Mycoplasma and Legionella gene amplification was not detected. Rural area and age over 40 years were the most frequent factors. Conclusion. This study provided an important overview of the diseases described, whose etiology is not identified by conventional diagnosis. Bacterial infection was detected in patients with CAP and negative cultures. DNA sequencing is key for the identification of pathogens. Further knowledge of pneumonias probably caused by Chlamydia spp is required.eng
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameBacteriólogo(a)
dc.description.modalityArtículo
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.instnameUniversidad de Córdoba
dc.identifier.reponameRepositorio Universidad de Córdoba
dc.identifier.repourlhttps://repositorio.unicordoba.edu.co/
dc.identifier.urihttps://repositorio.unicordoba.edu.co/handle/ucordoba/8211
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad de Córdoba
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias de la Salud
dc.publisher.placeMontería, Córdoba, Colombia
dc.publisher.programBacteriología
dc.relation.referencesMartínez Vernaza S, Soto Chavez MJ, Mckinley E, Gualtero Trujillo S. Neumonía adquirida en la comunidad: una revisión narrativa. Univ Médica. 19 de octubre de 2018;59(4):1-10.
dc.relation.referencesInostroza E, Pinto R. NEUMONÍA POR AGENTES ATÍPICOS EN NIÑOS. Rev Médica Clínica Las Condes. 1 de enero de 2017;28(1):90-6.
dc.relation.referencesMuñoz Bayona AB. Pruebas de laboratorio clínico como apoyo diagnóstico en enfermedades febriles. 6 de diciembre de 2022; Disponible en: http://repository.javeriana.edu.co/handle/10554/63187
dc.relation.referencesLopardo GD, Fridman D, Raimondo E, Albornoz H, Lopardo A, Bagnulo H, et al. Incidence rate of community-acquired pneumonia in adults: a population-based prospective active surveillance study in three cities in South America. BMJ Open. 10 de abril de 2018;8(4):e019439.
dc.relation.referencesRecomendaciones para el diagnóstico, tratamiento y prevención de la neumonía adquirida en la comunidad en adultos inmunocompetentes. Infectio. 1 de marzo de 2013;17:1-38.
dc.relation.referencesHercik C, Cosmas L, Mogeni OD, Wamola N, Kohi W, Omballa V, et al. A diagnostic and epidemiologic investigation of acute febrile illness (AFI) in Kilombero, Tanzania. PLoS ONE. 29 de diciembre de 2017;12(12):e0189712.
dc.relation.referencesLozano JA. Neumonía adquirida en la comunidad. Offarm. 1 de septiembre de 2003;22(8):82-5.
dc.relation.referencesVigilancia hospitalaria de etiologías infecciosas entre pacientes con enfermedades febriles agudas en Georgia, 2008-2011 - PMC [Internet]. Disponible en: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4710437/
dc.relation.referencesVerea LP, Méndez AR, Rodríguez AC, Reyes YO, Ferrer AF. Neumonía adquirida en la comunidad. Rev Cuba Med Intensiva Emerg [Internet]. 19 de julio de 2019. Disponible en: https://revmie.sld.cu/index.php/mie/article/view/478
dc.relation.referencesInostroza E, Pinto R. NEUMONÍA POR AGENTES ATÍPICOS EN NIÑOS. Rev Médica Clínica Las Condes. 1 de enero de 2017;28(1):90-6.
dc.relation.referencesParrott GL, Kinjo T, Fujita J. A Compendium for Mycoplasma pneumoniae. Front Microbiol [Internet]. 2016. Disponible en: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2016.00513
dc.relation.referencesZhao F, Cao B, He LH, Yin YD, Tao XX, Song SF, et al. Evaluation of a new real-time PCR assay for detection of Mycoplasma pneumoniae in clinical specimens. Biomed Environ Sci BES. febrero de 2012;25(1):77-81.
dc.relation.referencesSomogyi T, Alfaro W. Seroprevalencia de Chlamydia pneumoniae en una población pediátrica de Costa Rica. Rev Médica Hosp Nac Niños Dr Carlos Sáenz Herrera. enero de 1999;34:77-84.
dc.relation.referencesDiederen BMW. Legionella spp. and Legionnaires’ disease. J Infect. 1 de enero de 2008;56(1):1-12.
dc.relation.referencesF U, Teresa M. Legionella pneumophila. Rev Chil Infectol. junio de 2008;25(3):208-208.
dc.relation.referencesPérez-Arellano JL, Carranza Rodríguez C, Gutierrez C, Bolaños Rivero M. Epidemiología de la fiebre Q en España (2018). Rev Esp Quimioter. octubre de 2018;31(5):386-405.
dc.relation.referencesMontufar F, Rueda Z, Correa L, Vélez L, Ortega H, Ortega J. Características y comportamiento de la Neumonía Adquirida en la Comunidad (NAC) en adultos mayores (≥ 65 años) hospitalizados en el Valle de Aburrá, Antioquia, Colombia. Infectio. 1 de enero de 2006;10.
dc.relation.referencesCaballero A, Polania E, Gordillo MS, Martínez O, Torrado E, Lagos ML, et al. Agentes etiológicos de la Neumonía adquirida en la comunidad (NAC) en pacientes adultos inmunocompetentes que consultan al servicio de urgencias de la Clínica Reina Sofía. Bogotá, 2006-2007. Rev Médica Sanitas. 1 de abril de 2010;13(2):8-18.
dc.relation.references16S rRNA Sequencing: Identifying Bacterial Species by PCR [Internet]. Disponible en: https://app.jove.com/v/10510/16s-rrna-sequencing-a-pcr-based-technique-to-identify-bacterial-species
dc.relation.referencesRodicio M del R, Mendoza M del C. Identificación bacteriana mediante secuenciación del ARNr 16S: fundamento, metodología y aplicaciones en microbiología clínica. Enfermedades Infecc Microbiol Clínica. 1 de abril de 2004;22(4):238-45.
dc.relation.referencesValenzuela-González F, Casillas-Hernández R, Villalpando E, Vargas-Albores F, Valenzuela-González F, Casillas-Hernández R, et al. El gen ARNr 16S en el estudio de comunidades microbianas marinas. Cienc Mar. 2015;41(4):297-313.
dc.relation.referencesAkram A, Maley M, Gosbell I, Nguyen T, Chavada R. Utility of 16S rRNA PCR performed on clinical specimens in patient management. Int J Infect Dis IJID Off Publ Int Soc Infect Dis. abril de 2017;57:144-9.
dc.relation.referencesBasarab M, Macrae MB, Curtis CM. Atypical pneumonia: Curr Opin Pulm Med. mayo de 2014;20(3):247-51.
dc.relation.referencesEnfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica | Journal | ScienceDirect.com by Elsevier [Internet]. Disponible en: https://www.sciencedirect.com/journal/enfermedades-infecciosas-y-microbiologia-clinica
dc.relation.referencesIrigaray R, Dorca J. Neumonías atípicas. Arch Bronconeumol. 1 de abril de 1996;32(4):187-95.
dc.relation.referencesKlee SR, Tyczka J, Ellerbrok H, Franz T, Linke S, Baljer G, et al. Highly sensitive real-time PCR for specific detection and quantification of Coxiella burnetii. BMC Microbiol. 19 de enero de 2006;6(1):2.
dc.relation.referencesContreras V, González M, Guzmán C, Máttar S. Fiebre Q: una zoonosis olvidada en Colombia.
dc.relation.referencesContreras V, Máttar S, González M, Álvarez J, Oteo JA. Coxiella burnetii in bulk tank milk and antibodies in farm workers at Montería, Colombia. Rev Colomb Cienc Pecu. junio de 2015;28(2):181-7.
dc.relation.referencesContreras V, Gonzalez M, Alvarez J, Mattar S, Contreras V, Gonzalez M, et al. Coxiella burnetii infection in sheep and goats: a public risk health, Colombia. Infectio. diciembre de 2018;22(4):173-7.
dc.relation.referencesMáttar S, Parra M. Detection of antibodies to anaplasma, bartonella and coxiella in rural inhabitants of the Caribbean area of Colombia. Rev MVZ Córdoba. 2006;11(2):781-9.
dc.relation.referencesBetancur CA, Múnera AG. Endocarditis por Coxiella burnetii: fiebre Q. Acta Medica Colomb. enero de 2012;37(1):31-3.
dc.relation.referencesNeumonía por Coxiella burnetii: presentación de un caso y revisión de la literatura - Dialnet [Internet]. Disponible en: https://dialnet.unirioja.es/servlet/articulo?codigo=4162667
dc.relation.referencesRabaza A, Giannitti F, Fraga M, Lorenzo CP, Hirigoyen D. Fiebre Q: Rev Médica Urug. 28 de junio de 2022;38(2):e38209-e38209.
dc.relation.referencesPérez-Arellano JL, Carranza Rodríguez C, Gutierrez C, Bolaños Rivero M. Epidemiología de la fiebre Q en España (2018). Rev Esp Quimioter. octubre de 2018;31(5):386-405.
dc.relation.referencesDueck NP, Epstein S, Franquet T, Moore CC, Bueno J. Atypical Pneumonia: Definition, Causes, and Imaging Features. RadioGraphics. mayo de 2021;41(3):720-41.
dc.relation.referencesMiyashita N, Saito A, Kohno S, Yamaguchi K, Watanabe A, Oda H, et al. Multiplex PCR for the simultaneous detection of Chlamydia pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae and Legionella pneumophila in community-acquired pneumonia. Respir Med. junio de 2004;98(6):542-50.
dc.relation.referencesAbabneh HS, Ababneh MMK, Hananeh WM, Alsheyab FM, Jawasreh KI, Al-Gharaibeh MA, et al. Molecular identification of chlamydial cause of abortion in small ruminants in Jordan. Trop Anim Health Prod. diciembre de 2014;46(8):1407-12.
dc.relation.referencesSeimc-procedimientomicrobiologia25.pdf [Internet]. Disponible en: https://seimc.org/contenidos/documentoscientificos/procedimientosmicrobiologia/seimc-procedimientomicrobiologia25.pdf
dc.relation.referencesCunha BA. The atypical pneumonias: clinical diagnosis and importance. Clin Microbiol Infect Off Publ Eur Soc Clin Microbiol Infect Dis. mayo de 2006;12 Suppl 3:12-24.
dc.relation.referencesSánchez Olmedo JI, Jorge Amigo V, Pérez Alé M, Garnacho Montero J, Jiménez Jiménez FJ, Ortíz Leyba C. Neumonía comunitaria grave por Legionella pneumophila. Med Intensiva. 1 de diciembre de 2002;26(10):504-7.
dc.relation.referencesWaring AL, Halse TA, Csiza CK, Carlyn CJ, Musser KA, Limberger RJ. Development of a Genomics-Based PCR Assay for Detection of Mycoplasma pneumoniae in a Large Outbreak in New York State. J Clin Microbiol. abril de 2001;39(4):1385-90.
dc.relation.referencesPérez I, Gómez M, González Rico S. El diagnóstico convencional de Mycoplasma pneumoniae como agente causal de Neumonías Adquiridas en la Comunidad (NAC). Rev Soc Venez Microbiol. 2007;27(2):73-8.
dc.relation.referencesRoca B. Fiebre Q. An Med Interna. noviembre de 2007;24(11):558-60.
dc.relation.referencesSlabá K, Skultéty L, Toman R. Efficiency of various serological techniques for diagnosing Coxiella burnetii infection. Acta Virol. 2005;49(2):123-7.
dc.relation.referencesMáttar S, Visbal J, Bermúdez A. Zoonosis: cerca o lejos de nosotros? Rev MVZ Córdoba [Internet]. Disponible en: https://revistamvz.unicordoba.edu.co/article/view/548
dc.relation.referencesQuiles Machado JA, Aragón Domínguez V, Monsalvo Hernando M, Gómez Durán M. Neumonías bacterianas no neumocócicas (II). Infecciones respiratorias por Mycoplasma y Chlamydia. Neumonías víricas. Medicine (Baltimore). abril de 2018;12(54):3186-97.
dc.relation.referencesPrimera evidencia de circulación de Chlamydophila psittaci en Colombia: posible riesgo de salud pública [Internet]. Disponible en: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0124-00642011000200013&lng=e&nrm=iso&tlng=es
dc.rightsCopyright Universidad de Córdoba, 2024
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.licenseAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subject.keywordsPneumoniaeng
dc.subject.keywordsFebrile syndromeeng
dc.subject.keywordsAtypical microorganismseng
dc.subject.keywordsIFIeng
dc.subject.keywordsPCReng
dc.subject.proposalNeumoníaspa
dc.subject.proposalSíndrome febrilspa
dc.subject.proposalMicroorganismos atípicosspa
dc.subject.proposalIFIspa
dc.subject.proposalPCRspa
dc.titleDeterminación de la infección por patógenos atípicos en pacientes con neumonía adquirida en comunidad y síndrome febril agudo inespecífico que ingresaron al Hospital San Jerónimo de Montería, Córdoba 2021-2023spa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.coarversionhttp://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
dc.type.contentText
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dspace.entity.typePublication
Archivos
Bloque original
Mostrando 1 - 2 de 2
No hay miniatura disponible
Nombre:
INFORME FINAL TRABAJO DE GRADO MARI AVILÉS- LUISA ESPITIA (3).pdf
Tamaño:
1.86 MB
Formato:
Adobe Portable Document Format
Descargar
No hay miniatura disponible
Nombre:
Autorización Publicación repositorio.pdf
Tamaño:
413.7 KB
Formato:
Adobe Portable Document Format
Descargar
Bloque de licencias
Mostrando 1 - 1 de 1
No hay miniatura disponible
Nombre:
license.txt
Tamaño:
15.18 KB
Formato:
Item-specific license agreed upon to submission
Descripción:
Descargar
Colecciones
D.C.F. Articulos