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Validación analítica de un kit de extracción in house para la amplificación de ácido ribonucleico de sars-cov-2

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dc.contributor.advisorGastelbondo Pastrana, Bertha Irinaspa
dc.contributor.advisorMartínez Bravo, Caty Milenaspa
dc.contributor.authorDueñas Argumedo, Yemima
dc.date.accessioned2023-08-01T14:41:48Z
dc.date.available2023-08-01T14:41:48Z
dc.date.issued2023-07-13
dc.description.abstractLa emergencia sanitaria más grave de los últimos tiempos, producida por el virus SARS-CoV-2 generó un colapso en la salud y la economía de casi todos los países del mundo y ocasionó un déficit de recursos para su detección. La repentina aparición de la enfermedad trajo consigo un arduo proceso investigativo para la invención y mejora de técnicas moleculares indispensables para la detección de este virus. En este sentido, investigadores del Instituto de Investigaciones Biológicas del Trópico IIBT de la Universidad de Córdoba desarrollaron un kit in house para la extracción de ARN de SARS-CoV-2 y otros agentes biológicos de alto riesgo. En el siguiente trabajo, se tuvo como objetivo validar un kit de extracción in house para la amplificación de ácido ribonucleico de SARS-CoV-2, en el cual se determinó la estabilidad del kit, se realizó extracción de ARN a 50 muestras de hisopados nasofaríngeos de pacientes con síntomas de COVID-19 procesando la misma muestra con un kit comercial por perlas magnéticas y el kit de extracción in house. Se cuantificó y determinó la pureza del ARN extraído con los distintos protocolos mediante un espectrofotómetro, se realizó una RT-qPCR para detectar Gen E (gen de la proteína E de SARS-CoV-2) y RNasa P (Gen utilizado como control interno) y los resultados de Cq obtenidos para cada kit fueron comparados. Se determinó un porcentaje de positividad para estos datos. spa
dc.description.degreelevelPregradospa
dc.description.degreenameBiólogo(a)spa
dc.description.modalityPasantíasspa
dc.description.tableofcontents1. INTRODUCCIÓN ...................................................................................................... 1spa
dc.description.tableofcontents2. OBJETIVOS ............................................................................................................. 3spa
dc.description.tableofcontentsObjetivo General ........................................................................................................ 3spa
dc.description.tableofcontentsObjetivos Específicos ................................................................................................ 3spa
dc.description.tableofcontents3. MARCO REFERENCIAL .......................................................................................... 4spa
dc.description.tableofcontentsAntecedentes ............................................................................................................. 4spa
dc.description.tableofcontentsGeneralidades de SARS-CoV-2 ................................................................................. 5spa
dc.description.tableofcontentsMétodos de extracción o aislamiento de ácido ribonucleico (ARN) ..................... 8spa
dc.description.tableofcontentsValidación de pruebas diagnósticas ......................................................................... 13spa
dc.description.tableofcontents4. METODOLOGÍA ..................................................................................................... 15spa
dc.description.tableofcontentsTipo de estudio ........................................................................................................ 15spa
dc.description.tableofcontentsObtención y almacenamiento de muestras ........................................................... 15spa
dc.description.tableofcontentsMetodología desarrollada en el objetivo específico 1: ......................................... 15spa
dc.description.tableofcontentsMetodología desarrollada en el objetivo específico 2: ......................................... 19spa
dc.description.tableofcontentsMetodología desarrollada en el objetivo específico 3: ......................................... 26spa
dc.description.tableofcontents5. RESULTADOS ....................................................................................................... 27spa
dc.description.tableofcontentsEstabilidad de la formulación del buffer de lisis del kit de extracción in house 27spa
dc.description.tableofcontentsComparación de parámetros de pureza y concentración del ácido ribonucleico de SARS-CoV-2 extraído mediante el kit in house y un kit comercial de extracción por perlas magnéticas .......................................................................... 31spa
dc.description.tableofcontentsPrecisión diagnóstica del kit in house en la detección de material genético de SARS-CoV-2. ................................................................................................................ 33spa
dc.description.tableofcontents6. DISCUSIÓN ............................................................................................................ 36spa
dc.description.tableofcontents7. RECOMENDACIONES .......................................................................................... 39spa
dc.description.tableofcontents8. CONCLUSIONES ................................................................................................... 40spa
dc.description.tableofcontents9. BIBLIOGRAFIA ...................................................................................................... 41spa
dc.description.tableofcontents10. ANEXOS ............................................................................................................. 44spa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.identifier.urihttps://repositorio.unicordoba.edu.co/handle/ucordoba/7532
dc.language.isospaspa
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias Básicasspa
dc.publisher.placeMontería, Córdoba, Colombiaspa
dc.publisher.programBiologíaspa
dc.rightsCopyright Universidad de Córdoba, 2023spa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)spa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/spa
dc.subject.keywordsExtractionspa
dc.subject.keywordsRibonucleic acidspa
dc.subject.keywordsSARS-CoV-2spa
dc.subject.keywordsValidationspa
dc.subject.keywordsAmplificationspa
dc.subject.keywordsGenspa
dc.subject.keywordsKit in housespa
dc.subject.proposalExtracciónspa
dc.subject.proposalÁcido ribonucleicospa
dc.subject.proposalSARS-CoV-2spa
dc.subject.proposalValidaciónspa
dc.subject.proposalAmplificaciónspa
dc.subject.proposalGenspa
dc.subject.proposalKit in housespa
dc.titleValidación analítica de un kit de extracción in house para la amplificación de ácido ribonucleico de sars-cov-2spa
dc.typeTrabajo de grado - Pregradospa
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