Examinando por Materia "Microsatellites"

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    PublicaciónAcceso abierto
    Determinación de la diversidad genética y estructura poblacional del maíz criollo (Zea mays L.) de Sahagún, Córdoba mediante marcadores microsatélites
    (2021-07-22) Martínez Chartuny, Yan Carlos; Pardo Pérez, Enrique
    El objetivo del trabajo fue analizar la diversidad genética y la estructura poblacional del maíz criollo en el municipio de Sahagún, Córdoba, utilizando marcadores microsatélites. Se tomaron muestras de 50 accesiones de Z. mays. La extracción de ADN fue realizada empleando el método de extracción CTAB 2X y precipitación por acetato de sodio, se amplificaron 12 marcadores microsatélites y sus productos fueron separados en geles de poliacrilamida al 8%. Los 12 marcadores microsatélites evaluados presentaron un alto grado de polimorfismo, mostrando así un total de 65 alelos y con un promedio de 5,41 alelos en la población, el número efectivo de alelos promedio fue 2,23, los valores del PIC oscilaron entre 0,622 y 0,703 para las subpoblaciones de Arenas del Norte y Dividivi consecutivamente. El análisis para el equilibrio Hardy Weinberg manifestó que las poblaciones estaban en desequilibrio (p<0.05). El promedio de la heterocigosidad esperada fue de 0.47, conforme al parámetro de estructura poblacional FST los valores más altos correspondieron a los loci Phi031=0,559 y Phi115=0,269, mientras que el valor más bajo lo obtuvo el marcador Phi056=0,072, en general, las poblaciones tuvieron una media de FIS=0,560 y FIT=0,633. El dendrograma realizado a partir de las distancias de Nei presentó diferencias menores al 20% entre las poblaciones. La población de maíz criollo presentó una alta diversidad genética.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Diversidad genética y estructura poblacional de Psidium guajava en Valencia Córdoba-Colombia utilizando marcadores moleculares tipo STR’S
    (2024-07-13) Palacio Durango, Camila; Pardo Pérez, Enrique
    Objetivo. El objetivo de esta investigación fue evaluar la variabilidad y estructura genética de P. guajava L. en la población de Valencia del departamento de Córdoba, utilizando marcadores moleculares tipo microsatélites. Materiales y Métodos. Se analizaron 31 accesiones de Psidium guajava L., para la extracción de ADN se utilizó el método Mini-prep con modificaciones a partir de hojas jóvenes deshidratadas. Se evaluaron siete marcadores microsatélites; los productos de amplificación se analizaron mediante electroforesis vertical en geles de poliacrilamida al 8%. Resultados. Se encontraron un total de 26 alelos con un promedio de 3.7 alelos por locus. Las frecuencias alélicas oscilaron entre 0,063 y 0,929. La Heterocigosidad observada (Ho) y esperada (He) presentó valores promedio de 0.097 y 0.261 respectivamente indicando baja diversidad genética en las accesiones. El índice de fijación (F) presentó una media de 0,607 mostrando un exceso de homocigotos. La prueba de Hardy-Weinberg mostró que dos marcadores presentaron desequilibrios. Conclusión. Los 31 germoplasmas de Psidium guajava L. presentaron una baja diversidad genética reflejada en un alto número de homocigotos y niveles bajos de heterocigosidad. Además, las poblaciones, aunque presentan una diferenciación genética entre sí, tienden a agruparse al proceder de la misma región, lo que sugiere que las accesiones estudiadas corresponden a individuos emparentados.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Evaluación de la diversidad y variabilidad genética de guayaba (Psidium guajava) mediante marcadores microsatélites en el municipio de Montería, departamento de Córdoba-Colombia
    (Universidad de Córdoba, 2023-11-08) Ramos Rivero, Elizabeth; Pardo, Enrique; Causil Vargas, Luis Alfonso
    La guayaba (Psidium guajava L.) es un árbol frutal perteneciente a la familia Myrtaceae, cultivada en países tropicales y subtropicales. Sus frutos poseen excelentes propiedades nutricionales y medicinales importantes para la salud humana. Esta especie está ampliamente distribuida en el departamento de Córdoba, a pesar de esto, son escasos los estudios que se han llevado a cabo para conocer su diversidad genética. Por este motivo, el objetivo de esta investigación fue evaluar la diversidad y variabilidad genética de la guayaba (Psidium guajava) usando marcadores microsatélites en el municipio de Montería, departamento de Córdoba-Colombia. Se evaluaron 24 accesiones de P. guajava. Para la extracción de ADN se empleó el protocolo de extracción CTAB 2x con modificaciones. El ADN extraído se amplificó mediante la técnica PCR utilizando siete marcadores microsatélites; los amplicones se analizaron en gel de poliacrilamida al 8%. Se halló un total de 46 alelos con un promedio de 6,5 alelos por locus. Se identificó un total de 28 alelos privados en las poblaciones, los cuales posiblemente se han fijado por distintas fuerzas evolutivas. La población evaluada presentó un promedio de heterocigosidad esperada de 0,572 y la heterocigosidad observada fue menor (0,058). El índice de fijación (F) presentó un promedio total de 0,906, indicando que en Montería hay un exceso de homocigotos. Los valores de PIC permitieron determinar que los marcadores mPgCIR9, mPgCIR11, mPgCIR13, mPgCIR16, mPgCIR19 y mPgCIR22 son altamente informativos, mientras que mPgCIR23 es medianamente informativo. La población de guayaba en Montería presentó una baja diversidad genética dentro de las subpoblaciones, lo cual podría estar relacionado con eventos de endogamia como la autopolinización.