Examinando por Materia "Heterozygosity"

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    PublicaciónAcceso abierto
    Determinación de la diversidad genética y estructura poblacional del maíz criollo (Zea mays L.) de Sahagún, Córdoba mediante marcadores microsatélites
    (2021-07-22) Martínez Chartuny, Yan Carlos; Pardo Pérez, Enrique
    El objetivo del trabajo fue analizar la diversidad genética y la estructura poblacional del maíz criollo en el municipio de Sahagún, Córdoba, utilizando marcadores microsatélites. Se tomaron muestras de 50 accesiones de Z. mays. La extracción de ADN fue realizada empleando el método de extracción CTAB 2X y precipitación por acetato de sodio, se amplificaron 12 marcadores microsatélites y sus productos fueron separados en geles de poliacrilamida al 8%. Los 12 marcadores microsatélites evaluados presentaron un alto grado de polimorfismo, mostrando así un total de 65 alelos y con un promedio de 5,41 alelos en la población, el número efectivo de alelos promedio fue 2,23, los valores del PIC oscilaron entre 0,622 y 0,703 para las subpoblaciones de Arenas del Norte y Dividivi consecutivamente. El análisis para el equilibrio Hardy Weinberg manifestó que las poblaciones estaban en desequilibrio (p<0.05). El promedio de la heterocigosidad esperada fue de 0.47, conforme al parámetro de estructura poblacional FST los valores más altos correspondieron a los loci Phi031=0,559 y Phi115=0,269, mientras que el valor más bajo lo obtuvo el marcador Phi056=0,072, en general, las poblaciones tuvieron una media de FIS=0,560 y FIT=0,633. El dendrograma realizado a partir de las distancias de Nei presentó diferencias menores al 20% entre las poblaciones. La población de maíz criollo presentó una alta diversidad genética.
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    Diversidad genética en la población humana del municipio de Momil utilizando marcadores Alu
    (Universidad De Córdoba, 2024-08-09) Gómez Peñalosa, Mary Luz; Pardo Pérez, Enrique; Cavadía Martínez, Teodora Inés; Begambre Hernández, Mauricio; Álvarez Negrete, Ana Carolina
    Con el objetivo de caracterizar la población humana del municipio de Momil mediante la utilización de marcadores Alu, se tomaron muestras de saliva de 38 personas adultas no emparentadas de cuatro regiones del municipio tanto urbana como rural: barrio las Lamas (PM), barrio Bruselas (PS), barrio Santa Lucia (PR) y vereda Pueblecito (PP). Se realizó la extracción de ADN, se amplificaron 7 marcadores Alu (ACE, D1, APO, TRA25, HS3.23, HS2.43, PV92) mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y los amplicones fueron observados mediante electroforesis en geles de agarosa. Los análisis estadísticos mostraron que el marcador HS2.43 resulto ser monomórfico para todas las poblaciones, se presentó monomorfismos en el marcador HS3.23 para la población PS y en el marcador D1 para la población PP, las demás inserciones fueron polimórficas, la heterocigocidad observada promedio fue de 0,310 visiblemente mayor a la heterocigocidad esperada con un valor de 0,278, el marcador HS3.23 presento ausencia de equilibrio Hardy-Weinberg en la población PM, además se encontró una alta diferenciación genética entre las subpoblaciones, en conjunto, las variables de diversidad indican que la población de Momil es una región con alta diversidad genética y conforme a las distancias genéticas con poblaciones aledañas se muestra una alta similitud genética con los municipio de Lorica y Sincelejo.
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    Diversidad genética en poblaciones humanas de Sincelejo, Sucre-Colombia, determinada mediante polimorfismos de inserciones Alu.
    (2021-07-21) Conde vega, Eder Enrique; Pardo Pérez, Enrique
    The objective of this research was to determine the genetic diversity of the human population of Sincelejo, Sucre-Colombia through polymorphism of Alu insertions. Materials and Methods. The samples were obtained from 49 unrelated people in five localities of this population (Bogotá, Caribe, 20 de enero, Villa country, Cortijo), to which the DNA extraction protocol described in the Promega Wizard® Genomic DNA Purification Kit Technical Manual is applied, and were amplified by a series of polymerase chain reactions (PCR) using a series of Alu markers (ACE, A25, APO, D1, PV92, TRA25). Results. All the Alu markers evaluated in this research were polymorphic, the allelic frequencies presented an average of 0.305 with a maximum value of 0.551 for the TRA25 locus and a minimum value of 0.064 for the APO locus, a moderate heterozygosity observed in the population was detected, where the values presented a fluctuation of a minimum value of 0.125 for the APO locus and a maximum value of 0.471 for the PV92 locus. Marker D1 presents an absence of Hardy-Weinberg equilibrium for two subpopulations of Sincelejo (Villa Country and Caribe). Conclusion. The results obtained in this research allow us to conclude that the population of Sincelejo, Sucre-Colombia has low genetic diversity due to the fact that inbreeding processes have occurred throughout the history of this population.
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    PublicaciónAcceso abierto
    Diversidad genética en poblaciones humanas mediante polimorfismos de inserción Alu en el municipio de Moñitos- Córdoba
    (2020-11-13) Álvarez Villegas, Lizky Paola; Pardo Pérez, Enrique
    Alu insertion elements are DNA sequences that are produced by a single mutational event and their ancestral status is known, it is estimated that there are more than a million copies of these elements, that is, they occupy approximately 11% of the human genome. The objective of the present investigation was to determine the genetic diversity of the human population of the municipality of Moñitos-Córdoba, through the use of Alu insertion polymorphisms in 50 unrelated individuals from five selected populations in the municipality. The study was carried out from saliva samples, from which the DNA was extracted, later the DNA amplification was carried out by PCR and the amplified ones were observed in agarose gels, finally through statistical analysis the following were determined: allelic frequencies, Observed heterozygosities (Ho), Expected heterozygosities (He), Fixation index, Hardy-Weinberg equilibrium and Dendograms. All Alu markers were polymorphic, with frequencies ranging between 0.100 (A25) and 0.944 (HS3.23), the average values obtained for Ho and He were respectively 0.398 and 0.384, most of the markers were found in equilibrium of Hardy-Weinberg, except for the ACE and TRA25 markers, the genetic distance between the different populations studied, showed Miramar and Flores de Manga as the most related and Santa Lucia as the most distant among the populations evaluated. In conclusion, Moñitos population presented a high polymorphic level and low values of observed and expected heterozygosity, which indicates a low rate of genetic diversity.